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相似文献
 共查询到16条相似文献,搜索用时 296 毫秒
1.
探究烤鸭储存过程中菌群的变化,为延长其贮存期奠定理论基础.用酚、氯仿、异戊醇法提取烤鸭肉中细菌的基因组DNA,PCR扩增16SRNAV3区,用DGGE电泳技术分析菌群结构的变化情况,然后用Bionumerics软件对DGGE分子指纹图谱进行烤鸭肉菌群结构相似性分析.PCR结果表明,成功扩增了细菌基因组DNA,为230bp;DGGE实验结果表明,DGGE分子指纹图谱上条带存在显著差异;用bionumberics软件分析,发现样本相似度不断变化,表明在储存过程中,烤鸭肉菌群结构发生了变化.该研究为延长烤鸭肉保质期提供理论参考依据.  相似文献   

2.
酸奶在储存过程中菌群结构变化研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
为了探究酸奶储存过程中微生物菌群结构的变化,为其长期贮存奠定理论基础.采用酚/氯仿法抽提细菌基因组DNA,以此作为PCR反应的模板,进行16S rDNA基因有效扩增,并将PCR扩增产物进行DGGE电泳.用Bionumerics软件对DGGE分子指纹图谱进行舌苔菌群结构相似性分析.实验结果表明,采用该方法成功地扩增出16S rDNA V3区片段,为230 bp.DGGE分子指纹图谱结果表明,1、2号酸奶样品高相似性为93%,1-3号与4-7号的相似仅为6%,表明酸奶贮存过程中,菌群结构发生了变化.  相似文献   

3.
目的应用PCR-DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis,变性梯度凝胶电泳)技术对孤独症家庭成员肠道微生物菌群结构进行研究.材料和方法提取粪便细菌总基因组DNA,PCR扩增细菌16S rDNA基因V3可变区,DGGE方法检测PCR产物.结果建立了孤独症家庭成员肠道菌群组成的DGGE指纹图谱,分析结果显示孤独症儿童肠道菌群结构的相似度为0.42-0.65,家庭内孤独症儿童与父母之间的相似度为0.42-0.68.结论 PCR-DGGE技术是一种快速有效的用于分析研究人体肠道菌群结构的技术.孤独症儿童肠道菌群结构与父母的相似度较高,提示生活环境对肠道菌群的组成有影响.  相似文献   

4.
肠道菌群结构多样性初筛研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:探讨研究肠道菌群结构的初筛方法,为进行有效、高质量的高通量测序奠定基础.方法:用粪便采样器采集健康儿童粪便进行粪便标本预处理后,采用酚—氯仿方法提取样本菌群基因组DNA,并进行16S rDNAV3区片段PCR扩增,扩增产物用变性梯度凝胶电泳法(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)检测分析.结果:采用该方法成功地扩增出16S rDNA V3区230bp的片段,经DGGE的方法可以比较出不同儿童粪便样本菌群结构的不同.结论:基于16S rDNA V3区的PCR-DGGE技术能够应用于研究肠道微生物多样性,对于肠道微生物的研究起到了初筛的作用.  相似文献   

5.
目前研究发现人类的花生四烯酸代谢途径中5-脂氧合酶的第254位氨基酸发生一定突变后,此人一般为过敏体质,易患哮喘.本文介绍一种快速简便检测哮喘患者5-LO E254K突变基因的方法及详细步骤.方法:采2ml 外周血,用0.2%氯化钠处理收集白细胞,再用基因组DNA提取试剂盒抽提基因组DNA,用等位基因特异性PCR(AS-PCR)法直接对E254K多态性进行扩增分型.结果:用该方法检测5-脂氧合酶E254K多态性结果准确清晰.结论:用我们设计的引物可以对5-脂氧合酶E254K多态性直接扩增分型,跟测序法和限制性内切酶酶切法相比,具有经济、快速、简便、易行等特点.  相似文献   

6.
采用玻璃珠法从高温堆肥样品中进行了微生物总DNA的提取,以细菌16S rRNA基因 V3区通用引物进行了PCR扩增,随后用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对其微生物多样性进行评估.结果表明,玻璃珠法能够快速、有效地获得高质量的堆肥微生物总DNA,所得的DNA分子片段在15kb以上,使用细菌16S rRNA 基因通用引物(27F和1492R)对总DNA进行PCR扩增,获得了近全长的16S rDNA序列(约1.5kb);DGGE分析结果表明,用该方法提取到的DNA种类较为丰富,多样性较好,能够进一步应用于群落结构分析.因此,玻璃珠法提取的DNA可以用于堆肥微生物的分子生态学研究及微生物群落结构分析.  相似文献   

7.
目的 :比较三种不同的DNA提取方法提取人全血基因组DNA对DNA提取效率、纯度以及PCR扩增的效果影响。方法 :分别应用中山医科大学达安公司DNA提取液 ,珠海黑马医学仪器有限公司DNA提取液 ,胍盐酸法三种不同的方法提取人全血基因组DNA。结果 :三种方法提取的DNA纯度平均分别为 :1.4 8,1.5 1,1.5 6 ,各组间差异无显著性。 2 0 0 μL全血中所提取DNA总量平均分别为 1.6 μg ,2 .3μg ,4 .1μg。用 0 .8%琼脂糖凝胶电泳鉴定胍盐酸法制备的DNA效果较其它两种方法好 ,PCR扩增效果差异不明显。结论 :胍盐酸法提取的DNA总量明显高于其它两种方法 ,提取效率高 ,为三种全血基因组DNA提取方法中之首选。  相似文献   

8.
以龙竹和凤尾竹基因组DNA为模板,通过试验不同的退火温度、循环数、Mg2+浓度及DMSO浓度,获得了16条龙竹和凤尾竹PpMADS1相似序列片段,并得出稳定扩增PpMADS1相似序列的条件.对获得的龙竹和凤尾竹PpMADS1相似序列进行序列分析,发现龙竹和凤尾竹PpMADS1相似序列可根据序列长度差异分成组I和组II,并对其推出的氨基酸序列进行分析,找到了保守的paleoAP1基序和KIII区保守的氨基酸残基,并据此认为龙竹和凤尾竹PpMADS1相似序列是AP1/SQUA亚家族成员.  相似文献   

9.
目的:探讨Calpain-10基因(CAPN-10)单核苷酸多态性SNP19与2型糖尿病(T2DM)遗传易感性的关系。方法:从2型糖尿病患者外周血有核细胞中提取基因组DNA,运用聚合酶链式反应分别扩增Calpain-10基因第三个内含子包含SNP19多态性的DNA片断。将其扩增产物进行电泳分析,在紫外分析仪下观察结果并与正常人对照。结果:发现T2DM患者出现1-2条区带,而正常人则没有出现相应区带。结论:提示Calpain-10基因单核苷酸多态性SNP19可能直接或间接与2型糖尿病遗传易感性相关。  相似文献   

10.
《邢台学院学报》2017,(2):180-182
利用DNA条形码技术鉴别市场上出售的牛肉及其制品的原料来源,用以判定制品是否为牛肉制品。分别提取牛肉、牛肉丸及牛肉粒三种样品的基因组DNA,以牛肉线粒体细胞色素氧化酶COⅠ基因设计引物进行PCR扩增,将PCR产物进行凝胶电泳分析,对三种样品PCR扩增条带进行分析,发现三种样品碱基数目相仿,可以推断为三种样品来源为同一物种,再结合引物特异性,可以推断三种样品均含有牛肉成分。  相似文献   

11.
研究目的:评价毒死蜱施用后对土壤细菌和真菌群落结构的影响,并对降解功能菌株进行分析。创新要点:通过聚合酶链式反应–变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)方法,揭示了毒死蜱施用后土壤细菌和真菌群落结构动态变化,并对试验土壤中的降解菌群进行分子鉴定。研究方法:将农田土壤用终质量分数5 mg/kg和20 mg/kg毒死蜱处理,同时以不施用毒死蜱为对照,定期采集土样进行毒死蜱残留测定并提取土壤DNA。将提取的土壤总DNA作为PCR反应模板,细菌群落结构分析采用对大多数细菌16S rRNA基因V3区具有特异性的引物GC-341F和517R,真菌群落结构分析采用ITS区特异引物对GC-ITS1f和ITS2f。DGGE图谱经Quantity One软件进行数字化分析,各泳道中的条带经标准化处理之后,条带的相对光密度构成一个矩阵,用Matlab软件进行主成分分析(PCA),用Dice法计算相似性指数CS,用MEGA 4.1软件构建系统发育树,进行聚类分析。之后,采用LB、察氏和高氏三种培养基结合的纯培养分离方法,从毒死蜱处理土样中分离具有降解功能的菌株。分别提取纯培养物的染色体DNA,利用ERIC-PCR对分离到的降解菌进行基因组指纹图谱分析,将典型肠杆菌基因间的重复共有序列–聚合酶链式反应(ERIC-PCR)指纹图谱类型的代表菌株进行16S rRNA基因(细菌和放线菌)或ITS区(真菌)扩增并测序,测序结果提交GenBank基因库,并进行BLAST比对,初步确定降解菌株的分子地位。重要结论:本实验条件下,毒死蜱降解符合一级动力学,5 mg/kg和20 mg/kg毒死蜱浓度下的降解方程分别为y=5.252e-0.09x和y=19.41e-0.08x。DGGE指纹图谱显示,毒死蜱施用后土壤真菌群落结构与对照相比发生很大改变,且毒死蜱处理样品真菌群落结构保持基本稳定,多样性指数明显提高(见图2b);主成分分析显示,毒死蜱处理样品与对照明显分在2个不同的区域,充分表明毒死蜱对土壤真菌群落结构影响迅速且持久(见图3b)。毒死蜱处理样品细菌群落结构只在试验前30天与对照相比明显不同,60天时已经恢复对照水平(见图2a),同时主成分分析图上,毒死蜱处理样品与对照也越来越靠近,最后聚在一起(见图3a),说明毒死蜱对土壤细菌群落结构影响短暂。最后,获得了9个典型的ERIC型毒死蜱降解菌株。  相似文献   

12.
题目:改良型多介质土壤渗滤系统对甲鱼养殖废水的净化效果研究
  目的:通过向多介质土壤渗滤系统(MSL)的土壤层添加污泥,研究改进后的系统对工厂化甲鱼养殖废水的处理效果,分析系统内微生物群落的变化,以期部分揭示其可能的作用机理。
  创新点:工厂化甲鱼养殖废水排放量日益增大,且水体氨氮含量较高。目前市场上缺乏针对甲鱼养殖废水的处理技术,MSL系统对该废水的处理也未有报道。本文在 MSL 系统的基础上进行改良,并将其应用于甲鱼养殖废水处理上,提出一套有效的甲鱼养殖废水处理技术,并对 MSL 系统内微生物群落结构进行了分析。
  方法:向4套MSL小试装置中分别添加0%、5%、10%和20%污泥,研究其对工厂化甲鱼养殖废水的净化效果。试验中水质指标测定均按国家标准方法进行,系统内微生物群落结构采用聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)法测定。
  结论:MSL系统可有效地处理工厂化甲鱼养殖废水,向系统中添加20%污泥后处理效果更佳。添加20%污泥的系统内具有较高的硝化类细菌多样性和都较多的生物量。  相似文献   

13.
本研究利用大尺度的物种分布信息和植物区系信息,结合二元相关性分析,探讨了元江流域种子植物区系成分的总体构成和纬度分布格局。结果表明,研究区域共拥有种子植物5149种,分属于241科,1585属,是部分科、属在云南地区,甚至在中国的重要分布中心。在科水平上,泛热带成分(T2)所占比重较大(45.4%),其次为世界分布成分(T1)(22.4%)。在属水平上,所占比重较大的是热带亚洲成分(T7)(23.2%)和泛热带成分(T2)(18%)。且在科、属水平上,热带区系成分所占比重均在70%左右,温带区系成分比重在30%左右,表现出明显的热带区系性质,这可能与其处于低纬度、低海拔地区并紧邻古热带植物区系等有关。研究结果也表明,随着纬度的升高,温、热带区系成分比重分别呈递增和递减的趋势,这可能与环境梯度的纬度变化有关。同时,这也可能与元江流域在植物区系迁移过程中所发挥的"通道效应"有关。  相似文献   

14.
肺癌患者不同舌苔类型菌群结构分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
中医舌苔类型是中医诊断重要组成部分,中医舌苔形成机制复杂,其中舌苔菌群结构是影响舌苔形成的重要影响因素.该项研究收集肺癌病人不同舌苔类型样本,采用变性梯度凝胶电泳技术进行分子生物学分析,结果发现相同舌苔类型的不同样本之间有较高的相似性,提示舌苔类型与菌群结构相关,分析与鉴定菌群的组成可促进中医诊断标准化.  相似文献   

15.
Pollution discharge disturbs the natural functions of water systems. The environmental microbial community composition and diversity are sensitive key indicators to the impact of water pollutant on the microbial ecology system over time. It is meaningful to develop a way to identify the microbial diversity related to heavy metal effects in evaluating river pollution. Water and sediment samples were collected from eight sections along the Tiaozi River where wastewater and sewage were discharged from Siping City in northeastern China. The main pollutants contents and microbial communities were analyzed. As the primary metal pollutants, zinc (Zn) and arsenic (As) were recorded at the maximum concentrations of 420 and 5.72 μg/L in the water, and 1704 and 1.92 mg/kg in the sediment, respectively. These pollutants posed a threat to the microbial community diversity as only a few species of bacteria and eukaryotes with strong resistance were detected through denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). Acinetobacter johnsonii, Clostridium cellulovorans, and Trichococcus pasteurii were the dominant bacteria in the severely polluted areas. The massive reproduction of Limnodrilus hoffmeisteri almost depleted the dissolved oxygen (DO) and resulted in the decline of the aerobic bacteria. It was noted that the pollution reduced the microbial diversity but the L. hoffmeisteri mass increased as the dominant community, which led to the overconsuming of DO and anaerobic stinking water bodies. Water quality, concentrations of heavy metals, and the spatial distribution of microbial populations have obvious consistencies, which mean that the heavy metals in the river pose a serious stress on the microorganisms.  相似文献   

16.
本文结合我国现阶段工人阶级队伍状况,分析认为:在社会变动中,工会运动也悄悄改变,工会代表和维护职工合法权益应成为工会在市场经济条件下参与劳动关系调整的重要手段。新工会法突出和强化工会维护职能,从法律上保障了职工权利,具有重大的现实意义。  相似文献   

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