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1.
《河南职业技术师范学院学报(职业教育版)》2017,(6)
LMNA基因编码A型核纤层蛋白,其多聚体组成的网格状结构紧贴于核膜内侧,对细胞核起重要的机械支持作用.LMNA基因突变能导致人类骨骼肌、心肌、脂肪等组织病变.利用q RT-PCR技术分析了LMNA基因在南阳牛出生后背最长肌组织发育过程中的表达变化情况,结果发现LMNA基因在12月龄和18月龄时的表达量显著低于3月龄和30月龄时的表达量.比较了LMNA基因在4种不同部位的脂肪组织和4种不同部位的肌肉组织中的表达情况,发现该基因在脂肪组织中的表达量相对较高.分析了LMNA基因在牛多种组织器官中的表达情况,发现该基因在卵巢和皱胃中表达量较高,在下丘脑和垂体中的表达量较低.研究分析了LMNA基因在牛肌肉、脂肪等多种组织中的表达变化情况,为从生物力学方向探讨肌肉发育和脂肪沉积的分子调控机制提供了铺垫. 相似文献
2.
Ya WANG Meng-yun XU Jian-ping LIU Mu-gui WANG Hai-qing YIN Ju-min TU 《Journal of Zhejiang University. Science. B》2014,(7)
研究目的:通过研究水稻泛素缀合酶基因OsUbc13的序列特征、表达模式、亚细胞定位模式及其互作分子,为深入研究该基因的生物学功能和分子作用机理奠定基础。创新要点:首次对植物Ubc13进行了亚细胞定位研究及蛋白互作研究。研究方法:通过序列比对及聚类分析进行OsUbc13的序列特征研究;通过实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)进行OsUbc13的表达模式分析;通过聚乙二醇(PEG)介导转化烟草BY-2原生质体进行OsUbc13亚细胞定位研究(见图4);通过酵母双杂交进行OsUbc13的蛋白质互作分析(见图5和表1)。重要结论:OsUbc13编码具有153个氨基酸的蛋白质,其推断的氨基酸序列与其它同源序列具有很高的相似性;该基因在水稻各组织中均有表达,其中内稃、雌蕊、雄蕊和叶片中的表达量较高,而根、茎和外稃中的表达量较低;低温、甲基磺酸甲酯(MMS)和过氧化氢(H2O2)胁迫处理使胚性愈伤中OsUbc13的表达量显著上调,甘露醇、脱落酸(ABA)和氯化钠(NaCl)胁迫则使愈伤组织中该基因的表达量降低;OsUbc13与绿色荧光蛋白(GFP)的融合蛋白表达于质膜和核膜处;酵母双杂交结果表明约有20个蛋白可能与OsUbc13存在相互作用,其中OsVDAC(与细胞凋亡有关)、OsMADS1(与花器官发育有关)、OsB22EL8(与活性氧清除及DNA保护有关)和OsCROC-1(为Lys63聚合泛素链形成及运行无误性DNA损伤耐受机制所必需)四个蛋白经验证确与OsUbc13互作。 相似文献
3.
目的:从大麦全基因组中鉴定AS2/LOB基因家族,并进行基因进化、基因结构、染色体定位以及组织、表达分析,为大麦ASL/LBD基因进一步功能研究与鉴定奠定基础。创新点:首次在大麦全基因组水平上分析AS2/LOB基因家族,并对部分基因的功能进行预测和分析。方法:利用大麦基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定大麦AS2/LOB基因家族成员;采用MEGA6软件进行系统进化树分析;利用GSDS及Map Draw工具进行基因结构及染色体定位分析;利用已有的大麦RNAseq数据进行组织表达谱分析。结论:通过全基因组分析,大麦AS2/LOB家族基因包括24个成员,在进化上分为两大类,7个亚家族,分布于大麦7条染色体上,组织表达模式具有多样性,与已经报道的ASL/LBD基因具有良好的同源性。这些信息为大麦AS2/LOB基因家族的功能分析奠定了基础。 相似文献
4.
目的:揭示水稻低植酸基因OsLpa1的分子生物学特征,特别是深化对其可变剪切和表达的时空和组织特征,以及蛋白亚细胞定位的认识。创新点:确定了OsLpa1存在的三种剪切方式,明确了三种转录本在不同组织和发育时期丰度的变化;揭示了OsLpa1表达的组织和时空差异,确定其在根、种子糊粉层细胞和花丝中高度表达;明确了三种转录本编码的蛋白均定位于亚叶绿体。方法:通过培育OsLpa1启动子与β-葡萄糖醛酸糖苷酶(GUS)杂合基因的转基因植株,通过不同组织的GUS组织化学染色确定OsLpa1表达的组织特异性;通过设计特异性引物确定OsLpa1存在的转录方式,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)分析三种转录本在不同组织和发育时期的丰度;采用OsLpa1三种转录本与绿色荧光蛋白(GFP)基因构建杂合基因并在水稻原生质体中的瞬时表达,在共聚焦显微镜下观察蛋白的亚细胞定位。结论:OsLpa1在根、茎、叶和花丝有强烈的表达。它存在三种可变剪切方式,产生的三种转录本存在明显的时空和组织差异,但其编码的蛋白均定位于叶绿体。 相似文献
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《赣南师范学院学报》2020,(6):87-93
生物体内的铁蛋白Ferritin在储存和释放铁离子、抗氧化胁迫和病菌侵染过程中发挥着重要作用.为探索玉带凤蝶(Papilio polytes)铁蛋白的功能,本研究开展了对玉带凤蝶铁蛋白亚基的鉴定,分析其组织表达谱和铁离子胁迫下的表达水平.基于玉带凤蝶基因组数据库,鉴定了铁蛋白轻链亚基(PpFerLCH)和重链亚基(PpFerHCH)基因并且克隆出2个基因的开放阅读框(ORF);利用生物信息学,对其结构域以及与其他物种的进化关系进行分析;采用实时荧光定量PCR技术分析两个亚基在不同组织以及铁离子胁迫下的表达水平.玉带凤蝶PpFerLCH基因cDNA全长为1207 bp,其开放阅读框为696 bp,编码231个氨基酸,预测其蛋白分子量为26.5 kDa,理论等电点为5.64;PpFerHCH基因cDNA全长为1 300 bp,ORF为636 bp,编码211个氨基酸,预测其蛋白分子量为23.7 kDa,理论等电点为6.53.结构域分析显示PpFerLCH和PpFerHCH都含有一个保守的铁蛋白结构域,而PpFerHCH具有Ferrihydrite nucleation center.系统发育树分析揭示PpFerLCH主要与烟草天蛾(Manduca sexta)以及大蜡螟(Galleria mellonella)铁蛋白重链亚基保持较高的同源性,而PpFerHCH与烟草天蛾具有较近的亲缘关系.实时荧光定量PCR分析表明PpFerLCH和PpFerHCH在玉带凤蝶的中肠和马氏管中表达量较高,而在其他组织表达量相对较低.此外,FeCl_3刺激24以后,PpFerLCH和PpFerHCH能够被显著诱导上调表达.本研究为进一步研究玉带凤蝶铁蛋白的功能奠定基础. 相似文献
6.
目的:鉴定去势抵抗性前列腺癌(CRPC)的关键基因。创新点:(1)结合多个数据库数据,运用生物信息学方法鉴定CRPC的关键基因;(2)首次报道PTPRR可能在CRPC里起关键作用。方法:通过下载三个GEO数据库的m RNA微阵列数据,分析CRPC和激素敏感前列腺癌之间的基因差异,对筛选出的差异基因进行功能富集分析和蛋白质间相互作用分析,最终筛选出两个有重要功能的差异基因(PTPRR和JAG1)。通过在多个其他数据库中进行表达量验证和生存分析,进一步证明这些基因的重要作用。结论:PTPRR和JAG1在CRPC中显著增高,并与预后差相关。因此,这两个基因有可能作为CRPC的诊断和预后的生物标志物。 相似文献
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以β-actin为内参基因,通过荧光PCR方法,分析了翻译调控肿瘤蛋白（TCTP）基因在南美白对虾不同组织中的表达情况,结果表明,TCTP基因在对虾的各种组织中均有表达,但在肌肉中表达量最高,而心脏中的表达最低． 相似文献
8.
生肌决定因子 MyoD 是生肌调节因子 MRFs 家族的一个重要成员,在基因转录调控中起着重要的作用.本实验通过 RT-PCR 和3’-RACE 等方法,以松江鲈肌肉总 RNA 为模板,扩增出957 bp 的 MyoD 基因部分序列,包含部分编码区长567 bp,编码翻译188个氨基酸残基,3’-UTR 区长390 bp.系统发育分析表明,松江鲈 MyoD 与奥尼罗非鱼亲缘关系最近.不同组织半定量分析显示,松江鲈 MyoD 在各种组织中均有表达,在心脏中表达量最高,预示着在不同组织中该基因的功能广泛 相似文献
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鹅MYL1基因的克隆及胚胎期表达特征分析 总被引：1，自引：0，他引：1
肌球蛋白是肌纤维的主要组成成分,在肌肉生长和收缩过程中具有重要作用.本研究以鹅（Anser anser）肌肉总RNA为模板,采用RACE的方法,克隆肌球蛋白轻链1（MYL1）基因全长cDNA序列,并进行生物信息学分析.运用实时荧光定量PCR检测MYL1基因在鹅胚胎期的表达特征.结果表明,鹅MYL1基因全长cDNA为1542 bp,编码193个氨基酸残基的肽链.预测鹅MYL1蛋白等电点5.12,分子量21.75 KD,具有典型的EFh和FRQ1结构域,且不同物种间EFh氨基酸序列高度同源.荧光定量PCR结果显示鹅胚胎期MYL1基因mRNA表达量总体呈现上升后下降的趋势,该基因在胚胎期E7就有表达,E7以后表达量逐渐上升,在E18表达量达到高峰后下降.研究结果首次提供了鹅肌肉组织主要结构基因MYL1的全序列和蛋白特征信息,并揭示该基因在鹅肌肉组织发生和发育的功能. 相似文献
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Sheng-xin CHANG Chu PU Rong-zhan GUAN Min PU Zhi-gang XU 《Journal of Zhejiang University. Science. B》2018,(8)
目的:研究不同比例红蓝光下苗期油菜表型、转录和蛋白水平的差异。创新点:利用转录组和蛋白组技术对不同红蓝光质下油菜叶片的分子表达进行检测,并探讨了其与叶片表型响应的关系。方法:采用数字基因表达谱和双向电泳技术检测红蓝光处理后油菜叶片的基因和蛋白表达水平,并分析处理间的差异。结论:不同比例红蓝光下,油菜叶片转录组和蛋白组呈系统性变化。高比例红光诱发叶片表皮发育和解剖结构形态建成相关基因的表达,它们可能与高比红光诱发的遮阴应答相关。高比蓝光促进叶绿体相关基因的表达,它们可能与高比蓝光下阳生型叶绿体的形成相关。红蓝单色光诱发胁迫应答相关蛋白的表达,而红蓝复合光促进碳氮代谢和次生代谢相关蛋白的表达。 相似文献
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目的:探究新发现的两个miRNA对家蚕丝素轻链基因BmFib-L的调控作用。创新点:在家蚕后部丝腺中发现两个新的miRNA,并首次证明它们对家蚕丝素蛋白轻链基因BmFib-L有负调控作用。方法:本实验通过生物信息学分析,从家蚕后部丝腺miRNA高通量测序获得的新miRNA中,筛选出两个可能对家蚕丝素蛋白轻链基因BmFib-L有调控作用的miRNA,即bmo-miR-0001和bmo-miR-0015。设计茎环引物,采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法对家蚕5龄3 d头部、表皮、脂肪体、马氏管、精巢/卵巢、丝腺(前、中、后)、气管、中肠和血淋巴细胞等12个不同组织的bmo-miR-0001和bmo-miR-00015进行半定量表达分析。并采用双荧光报告基因检测系统进一步在细胞水平上验证bmo-miR-0001和bmo-miR-0015对BmFib-L表达的调控作用。结论:本实验中RT-PCR结果显示,这两个新miRNA在家蚕后部丝腺中表达量最高(图4)。双荧光报告基因检测结果显示,报告基因荧光素酶活性明显低于阳性对照组(图7),转染bmo-miR-0001和bmo-miR-0015表达载体的细胞,报告基因和荧光素酶活性分别只及对照组60%和69%。t检验分析结果显示两个实验组与对照组之间差异都达到显著水平(P0.05)。由此可见,bmo-miR-0001和bmo-miR-0015在体外对BmFib-L的表达具有显著的抑制作用。 相似文献
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目的:研究CIDE家族基因在肥胖型和瘦肉型猪的脂肪、肝脏及肌肉组织中的基因表达水平差异,并初步探CIDE家族基因与脂质代谢的关系。创新点:首次在肥胖型与瘦肉型猪模型中解释CIDE家族基因可以调节脂质代谢,并有助于脂肪沉积及导致肥胖。方法:采用荧光定量聚合酶链式反应(qP CR)检测肥胖型蓝塘猪和瘦肉型杜长大猪的脂肪、肝脏和骨骼肌中CIDE家族基因、SREBP-1c、PGC-1α、HNF-4α、FASN、DGAT1和DGAT2、perlipin 2等基因表达水平。采用血浆生化指标仪试剂盒检测两个品种猪血浆中甘油三酯、葡萄糖、游离脂肪酸及胆固醇的含量。结论:肥胖型蓝塘猪脂肪和背最长肌组织中的Cidea和Cidec,及肝脏中Cidec的基因表达量明显高于瘦肉型杜长大猪。在脂肪组织中,脂质代谢相关的基因(包括SREBP-1c、PGC-1α、HNF-4α、FASN、DGAT1和DGAT2基因)表达量都是蓝塘猪高于杜长大猪。蓝塘猪肝脏中的SREBP-1c、HNF-4α和PGC-1α基因表达水平显著高于杜长大猪。蓝塘猪背最长肌组织的SREBP-1c、HNF-4α、PGC-1α和DGAT2基因表达量高于杜长大猪。然而,蓝塘猪的脂肪、肝脏及背最长肌三种组织中的perlipin 2的表达量显著低于杜长大猪。此外,蓝塘猪血浆中的甘油三酯、葡萄糖及游离脂肪酸浓度明显高于杜长大猪。通过相关性分析,我们发现肥胖型和瘦肉型猪不同组织中的CIDE家族基因表达水平与背部脂肪厚度、腹部脂肪重量、血浆中的甘油三酯、葡萄糖及游离脂肪酸浓度有明显的正向相关性。综上所述,CIDE家族基因可以调节脂质代谢,并促进脂肪沉积及导致肥胖。 相似文献
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基因表达分析如定量PCR、RNA印记等需要应用内参基因对目标基因表达量进行校正,以期获得真实可靠的结果,管家基因是常用的内参基因。热带兰金钗石斛中管家基因的研究至今尚无报道。该文对金钗石斛腋芽cDNA文库中的5个管家基因的序列和基因表达进行了分析和检测。其中,4个基因编码泛素蛋白,1个编码a-微管蛋白,分别命名为DnUBQ1、DnUBQ2、DnUBQ3、DnUBQ4及DnTUA1.DnUBQ1基因的密码使用频率表现出与金钗石斛普遍密码子不同的偏好性。在低温春化前后和春化过程中,5个基因的表达均无明显改变,表现为组成型表达。因此,5个基因均可在研究金钗石斛春化相关基因的表达时作为参照基因使用。 相似文献
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Jun MA Teng-long GUO Qing-lian WANG Kun-bo WANG Run-run SUN Bao-hong ZHANG 《Journal of Zhejiang University. Science. B》2015,(4):296-303
目的:探索16个保守microRNA在雷蒙德氏棉中的表达情况。创新点:首次研究了microRNA在雷蒙德氏棉四个组织的表达情况。方法:设计16个microRNA的引物,并提取雷蒙德氏棉四个不同组织的RNA进行实时荧光定量聚合酶链式反应(q RT-PCR)。结论:在不同的组织中,这些micro RNA的表达水平差异很大。包括miR-159、miR-162、miR-164、miR-172、miR-390、miR-395、miR-397和miR-398在内的8个micro RNA在花蕾中表达含量非常高,而另外一些microRNA,例如miR-166和miR-160,在四个不同组织中都有很高的表达量。 相似文献
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1-脱氧野尻霉素(1-deoxynojirimycin,DNJ)是存在于桑树中的一种多羟基哌啶生物碱,因其通过抑制α-葡萄糖苷酶活性,进而具有降血糖、抗病毒、抗肿瘤等生理活性和药理活性.DNJ广泛存在于桑树的各种组织中,不同桑树类型和品种中DNJ含量不同,采取的每一种提取、测定方法均具有选择性和特异性,只适用于某种类型或某种桑树品种样品的纯化和检测.同时,DNJ在桑树体内的含量较低,而且桑树体内其他次生代谢物质的干扰增加了DNJ提取和测定的难度.因此,目前文献中报道的DNJ提取、分离纯化和检测方法较多.针对已报道的DNJ的提取、分离纯化和检测方法,综述了近年来DNJ研究方面的最新进展,为更好利用和开发DNJ制品,为DNJ的工业化生产提供参考和借鉴. 相似文献
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生肌调节因子（MRF）基因家族的表达决定着肌细胞的命运,并控制其增殖和分化．Myf5是生肌调节因子MRF基因家族中的一个成员．本文提取赤眼鳟肌肉总RNA,采用RT—PCR技术获得赤眼鳟Myf5基因的部分cDNA序列,共338bp,编码112个氨基酸,含有部分bHLH结构．通过同源性分析发现赤眼鳟Myf5基因编码区与草鱼的同源性高达97．34％．半定量RT—PCR分析表明赤眼鳟Myf5基因在心脏和肾脏中表达量较高,鳃和肌肉中表达量次之,肝脏、脑和肠中表达量较弱．本结果为进一步研究该基因对肌肉生长发育的作用机理奠定了基础． 相似文献
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《河南职业技术师范学院学报(职业教育版)》2016,(1)
甲状腺转录因子-1(TTF-1)是NKx组织特异性转录因子家族中的一员.TTF-1基因可能是调节哺乳动物初情期的关键基因.采取山羊的甲状腺、下丘脑、垂体、大脑、卵巢等与青春期发育和繁殖性能有关的组织样,采用RT-PCR方法来检测TTF-1基因在以上组织中的表达特性.结果表明:TTF-1基因在甲状腺、下丘脑、垂体、大脑、卵巢中均有表达,为进一步研究山羊TTF-1基因及其对哺乳动物繁殖性能的影响提供理论基础. 相似文献
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目的:研究青蒿异分支酸合酶的表达模式,评价其对青蒿素含量的影响。创新点:该研究首次克隆了青蒿异分支酸合酶基因(AaICS1),并发现AaICS1影响青蒿素的合成,为更有效地开发利用青蒿提供了新思路。方法:根据青蒿转录组数据,利用聚合酶链式反应(PCR)克隆AaICS1基因和启动子,并进行多重序列分析和启动子作用元件预测。通过实时定量PCR(q RT-PCR)对AaICS1进行表达分析,用Southern杂交分析AaICS1的拷贝数。构建AaICS1过表达载体和干扰表达载体,转化青蒿获得转基因植株,用高效液相色谱法(HPLC)分析青蒿素含量。结论:AaICS1含一个总长为1710 bp的完整阅读框,编码570个氨基酸,与其它植物的ICS基因具有较高的相似性。Southern杂交结果表明AaICS1为单拷贝(图4),q RT-PCR结果显示该基因能够响应伤害、干旱、盐胁迫和水杨酸的处理,处理后基因表达量提高(图6),和启动子作用元件预测相符。q RT-PCR结果显示过表达转基因青蒿中AaICS1表达量提高,干扰转基因青蒿中该基因表达量降低(图7)。HPLC显示过表达AaICS1转基因植株中青蒿素含量提升,最高可达对照的1.9倍(图8)。 相似文献