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相似文献
 共查询到19条相似文献,搜索用时 484 毫秒
1.
生物信息学数据库资源建设   总被引:4,自引:0,他引:4  
大量的蛋白质和核酸数据的积累与理性地分析这些数据中所蕴涵的生物学意义的双重需要,产生了综合生物学研究与计算技术研究等领域最新成果的交叉性学科生物信息学。分别从生物信息学的基因组数据库,核酸和蛋白质一级结构序列数据库,生物大分子(主要是蛋白质)三维空间结构数据库,以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库包括基因组二次数据库、蛋白质序列二次数据库、蛋白质结构二次数据库,生物信息学数据库的集成系统等几个方面,概述了发展中的生物信息学数据库的最近动态和有关信息,同时对主要的热门生物信息学数据库站点和资源进行了评价。此外,就国内生物信息学数据库存在的问题与前景进行了讨论,指出生物信息学将是一次国际性的科学大协作,也是我国生命科学振兴的一个新契机。  相似文献   

2.
蛋白质组学数据库是蛋白质组学的主要内容之一,本文分别从生物信息学的蛋白质一级结构序列数据库,蛋白质三维空间结构数据库,以数据库和文献资料为基础构建的二次数据库包括蛋白质序列二次数据库、蛋白质结构二次数据库、蛋白质组数据库等几个方面,概述了发展中的蛋白质数据库的最近动态和有关信息,同时对主要的热门蛋白质数据库站点和资源进行了评价。此外,就国内生物信息学数据库开发与利用的问题与前景进行了讨论。  相似文献   

3.
基因库(GenBank)的电子邮件检索   总被引:3,自引:0,他引:3  
基因库(GenBank)是由美国国立卫生研究院、美国国立医学图书馆以及美国国家生物技术信息中心建立发行的,所有已知核酸和蛋白质序列及其文献和生物学注释的公共数据库。可以通过WWW、FTP、E—mail获取其中的数据,本文主要介绍了查询服务器的检索方法。  相似文献   

4.
自20世纪80年代第一个核酸和蛋白质序列数据库类似性检索方法发表以来,序列类似性检索成为核酸和蛋白质测序之后的常规操作,序列类似性检索方法也成为序列生物信息学分析的一种基本方法。在序列类似性检索方面已开发研制了多种不同的应用软件,如BLAST、FASTA、Search等,其中BLAST是最常用的检索软件之一。国内的科研人员大多凭经验利用BLAST进行序列类似性检索,未对其检索方法进行全面系统的研究。  相似文献   

5.
为了有效地实现信息资源的交换和共享 ,很多国际知名的实验室和研究机构均建立了各种蛋白质相关数据库。相对蛋白质序列数据库而言 ,蛋白质双向凝胶电泳 ( Two-dimensional gel electrophoresis,2 DE)图谱数据库分布比较分散。本文介绍了发布蛋白质 2 DE数据的主要研究机构 ,分门别类地作了综合性、哺乳类、植物类、微生物和真菌类等专业蛋白质 2 DE数据库的数据内容、特色评价 ,并对两个 2 DE专业搜索引擎的数据来源、检索功能等方面作了描述与评价。本文最后提出 ,今后蛋白质 2 DE数据库的建设过程中应加强数据的标准化、图谱显示格式的统一化  相似文献   

6.
以鳜鱼基因克隆为例,揭示了基于生物信息学的知识发现的全过程。利用Entrez、SRS等检索工具从GenBank、EMBL等核酸序列数据库、鱼类专业数据库获取相关鱼类的基因等信息,采用半经验值直观算法,以BLAST、FASTA方法结合Taxonomy分类数据库,选择恰当的过滤程序过滤掉效数据,最终获得与知识发现预期结果一致知识。  相似文献   

7.
GenBank数据库是世界上著名的生物信息数据库,包含了目前所有已知的核苷酸序列和蛋白质序列以及与它们相关的文献著作和生物学注释。详细介绍了它的Entrez检索功能。  相似文献   

8.
基因库的Entrez浏览检索   总被引:1,自引:0,他引:1  
基因库是美国国立卫生研究院(NIH),美国国立医学图书馆(NLM),美国国家生物技术信息中心(NCBI)等机构建立和发行的核酸序列数据库,是国际三大综合性核酸序列数据库之一。通过WWW、E-mail,FTP等方式获取其中的数据,本文着重介绍它的Entrez检索。  相似文献   

9.
迈向21世纪的生物信息学   总被引:4,自引:0,他引:4  
生物信息学是一门新兴交叉学科,被称为21世纪生物技术的核心。介绍生物信息学的概念、分类、应用和重要的生物信息学数据库,并对生物信息学的发展进行展望,指出生物信息学正处在科学发展的前夜。随着20世纪末生物学数据和信息的大量积累,21世纪必将导致科学上的重大发现。  相似文献   

10.
生物信息学   总被引:9,自引:1,他引:8  
生物信息学是生物技术的核心 ,是一门由生物、数学、物理、化学、计算机科学、信息科学等多学科交叉产生的新兴学科。本文介绍了生物信息学的概念 ,分析了发展生物信息学对现今科学发展的重大意义。根据生物信息学的发展特点 ,具体分析了生物信息学研究的内容 :基因组序列的分析 ;基因进化 ;药物设计 ;基因区域预测 ;基因功能预测 ;蛋白质结构预测。评述了生物信息学发展的现状 ,指出我国生物信息学发展中存在的问题 ,并对我国发展生物信息学提出了一些建议。最后分析了生物信息学发展的方向 ,展望了生物信息学的发展前景  相似文献   

11.
刘赪娜 《图书馆学研究》2011,(17):100-101,99
数据库是数字图书馆的重要组成部分,如果现有的法律制度对数据库的保护力度不足,就会严重影响到图书馆数据库制作者的利益,同时也会侵害数据库合法使用者的利益,不利于图书馆公共教育功能的发挥。我国数据库保护法律法规还不完善。文章通过介绍国内外的数据库保护模式及我国现行法律下图书馆对数据库保护的应对措施,提出了我国数据库保护的立法建议。  相似文献   

12.
在对WPI数据库与Espacene数据库进行比较分析的基础上,对以网上免费专利信息源替代WPI数据库的可能性进行了分析与研究,这对专利信息的检索具有重要意义.  相似文献   

13.
改进的AHP法在图书馆网络数据库选择中的应用*   总被引:4,自引:0,他引:4  
针对高校图书馆网络数据库评价选择中出现的指标多、随机性强等特点以及传统的层次分析法本身存在的固有缺陷,提出一种改进的层次分析法,应用它建立网络数据库的评价指标体系。计算出各评价指标的相对权重,采用专家给出的待选数据库各指标的属性值,最后通过线性加权获得评价结果,为图书馆选择网络数据库提供新的途径。  相似文献   

14.
委托建库-回溯书目数据库建设的新方式   总被引:3,自引:0,他引:3  
张明霞 《图书情报工作》2002,46(11):76-78,95
委托建库是我国书目数据制作市场化的成熟标志。委托建库具有时间短、效率高、数据质量较好等优点,并有利于回溯书目数据库建设的标准化。委托建库的图书馆应仔细规划整个委托建库工作的流程,重点注意选择数据制作公司、签署合同及数据质量控制等方面的问题,它是委托建库工作得以顺利实施的重要保证。  相似文献   

15.
To determine the mix of resources used in social gerontology research, a citation analysis was conducted. A representative sample of citations was selected from three prominent gerontology journals and information was added to determine subject scatter and database coverage for the cited materials. Results indicate that a significant portion of gerontology research, even from a social science perspective, relies roughly equally on medical resources as it does social science resources. Furthermore, there is a small but defined core of literature constituting scholarly “territory” unique to gerontology. Analysis of database indexing indicated that broad, interdisciplinary databases provide more comprehensive coverage of the cited materials than do subject-specific databases.  相似文献   

16.
Informetric researchers have long chafed at the limitations of bibliographic databases for their analyses, without being able to visualize or develop real solutions to the problem. This paper describes a solution developed to provide for the specialist needs of informetric researchers. In a collaborative exercise between the fields of computer science and informetrics, data modelling was used in order to address the requirements of complex and dynamic informetric data. This paper reports on this modelling experience with its aim of building an object-relational database (ORDB) for informetric research purposes. The paper argues that ORM (object-relational model) is particularly suitable because it allows for the modelling of complex data and accommodates the various data source formats and standards used by a variety of bibliographic databases. Further, ORM captures the dynamic nature of informetric data by allowing user-defined data types and by embedding basic statistical calculating tools as object functions in these user-defined data types. The main ideas of the paper are implemented in an Oracle database management system.  相似文献   

17.
高校图书馆商业数据库评价指标体系研究   总被引:35,自引:0,他引:35  
建立一个科学、合理的数据库资源评价体系,有助于图书馆数据库资源的优化与图书馆整体资源的开发与建设。评价指标体系包括数据库内容、检索系统功能、使用情况、数据库的性能价格比、数据库服务等5个一级指标和若干二级指标。参考文献4。  相似文献   

18.
EBSCO数据库的综合评价——与ProQuest平台的比较   总被引:2,自引:0,他引:2  
EBSCO和ProQuest数据库是目前各图书馆常用的外文数据库。通过对EBSCO数据库和ProQuest数据库的内容、检索系统的比较来看,EBSCO数据库的核心期刊收录比率较高、期刊品种较多、保持更新的全文刊较多、全文期刊收录的时间跨度较长,而且其检索功能和技术相对更强大一些,更有利于精确检索,更能体现专业数据库的特殊性。在数据库的使用方面,各个图书馆可根据自己的使用情况核算成本,应选择数据库内容和检索系统收录质量较高、综合优势较强的平台。  相似文献   

19.
论文通过比较分析建立日文书目数据库可利用的几种外部数据源,确认了CALLS联机目录日文书目数据库为最佳的外部数据源,并探讨了利用CALLS书目数据进行日文书目数据库建设应注意的若干问题。  相似文献   

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