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| 基于时间序列的DNA特征分析 | |
| 摘 要： | 生物与生态构成的统一整体称为生态系统,在这个系统中,生物与环境相互影响、相互制约,并形成了相对稳定的生态平衡状态。对不同物种的生物信息进行研究具有重大意义。生物信息学的主要研究对象由DNA、RNA和蛋白质分子构成,这些大分子中含括了物种进化和遗传的所有信息。其中DNA里的线粒体是生物系统研究中应用最为广泛的遗传物质之一,具有进化速率快,在遗传过程不发生基因重组、倒位、易变等突变,严格遵守母系遗传方式的特点。本文中对于30个哺乳动物的线粒体DNA进行研究,利用短记忆ARIMA模型做出详细阐述,概述了线粒体DNA携带mtDNA的一般属性。我们首先对于30个物种随机抽取5个物种的线粒体DNA(位置4,70个碱基)的碱基序列,对其进行时序化;然后利用ARIMA模型进行模型识别、参数估计、模型诊断(检验及优化)、进行预测(碱基位置71-75)。结果表明:在短记忆模型ARIMA(p,q)模型高度显著拟合下,其作为合适的时间序列模型能帮助我们挖掘DNA序列中的未知特性。 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ | |