基于蚁群算法的分子对接搜索方法研究 |
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引用本文: | 常珊,田绪红,陈琰.基于蚁群算法的分子对接搜索方法研究[J].乐山师范学院学报,2010,25(5):45-47,76. |
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作者姓名: | 常珊 田绪红 陈琰 |
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作者单位: | 华南农业大学信息学院,广东,广州,510642 |
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基金项目: | 广东省科技计划资助项目 |
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摘 要: | 分子对接方法研究生物大分子的相互作用与识别机制,对了解生命现象及其本质规律具有重要的理论和应用价值.本文采用蚁群算法对分子对接程序Autodock 3.0的能量寻优过程进行了改进.测试了22个蛋白质-小分子体系,与原程序相比较,蚁群算法能够有效地改善程序的搜索结果.同时,比较了采用局部搜索和未采用局部搜索的算法,蚁群算法也比原程序有更好的表现.蚁群算法对分子对接的搜索方法进行了新的尝试,将对分子对接软件的改进提供一些启示.
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关 键 词: | 分子对接 蚁群算法 遗传算法 能量优化 |
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