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一种侵染Cladosporium cladosporioides的新病毒研究
摘    要:在1株污染半夏组培苗的枝状枝孢真菌(Cladosporium cladosporioides DF15)中检测到5条双链RNA(double-strand RNA,ds RNA)条带。通过M-SPAT(modified single-primer amplification technique)、克隆测序获得5条ds RNA的序列信息,分别为ds RNA1(2434bp)、ds RNA2(2241bp)、ds RNA3(2008bp)、ds RNA4(1261bp)和ds RNA5(942bp)。经Blast比对,ds RNA1编码蛋白的氨基酸序列与侵染荚孢壳科、球腔菌科真菌的双分病毒属(Partitivirus)病毒,以及侵染辣椒等植物的双分病毒科(Partitiviridae)病毒的依赖于RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,Rd Rp)序列相似度最高。氨基酸序列系统进化树分析表明,ds RNA1与侵染真菌的双分病毒属病毒亲源关系更近。通过核苷酸序列5'非编码区(untranslated regions,UTR)的比对发现,5条ds RNA的5'UTR序列相似度高达50.0%~95.3%,并含有2段保守序列5'-GUAAAUAAACCUU-3'和5'-C(/G)TA(/AG)CAAGT(/C)AT-3'。根据上述分析,推测5条ds RNA序列来自同1种病毒基因组,并且为侵染C.cladosporioides的1种新双分病毒科双分病毒属病毒,命名该病毒为C.cladosporioides virus 1。


Study of A New Virus Infecting Cladosporium cladosporioides
Abstract:
Keywords:
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