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DGGE和qPCR联用定量分析环境样品中优势菌群
引用本文:付小花,李艳丽,乐毅全,王磊.DGGE和qPCR联用定量分析环境样品中优势菌群[J].实验技术与管理,2012,29(9):45-47,50.
作者姓名:付小花  李艳丽  乐毅全  王磊
作者单位:1. 同济大学污染控制与资源化研究国家重点实验室,环境科学与工程学院,上海200092;上海市城市化生态过程与生态恢复重点实验室,上海200062
2. 同济大学海洋地质国家重点实验室,上海,200092
3. 同济大学污染控制与资源化研究国家重点实验室,环境科学与工程学院,上海200092
基金项目:国家自然科学基金资助项目(40571145,40871217);污染控制与资源化研究国家重点实验室基金资助项目(PCRRY11011);上海市城市化生态过程与生态恢复重点实验室开放基金资助(2010)
摘    要:精确定量环境样品中特定微生物类群的数量对阐明环境生物治理/修复过程中微生物的功能和效应具有重要意义.该文以土壤样品为例,将PCR-DGGE技术与定量PCR(qPCR)技术联用,定量检测样品中优势微生物类群数量.方法:抽提样品DNA,针对16S rDNA进行PCR-DGGE分析,明确样品中的优势菌群;再根据特定优势菌群的基因序列设计适合的定量引物,通过针对特定优势菌群的定量PCR分析,得到样品中优势菌群的数量信息.该方法灵敏度高、重复性好,并且无需培养,最大限度地保持了样品原始群落信息.

关 键 词:优势菌群  定量检测  DGGE  定量PCR(qPCR)

Quantitative analysis of dominant bacteria in environmental samples based on DGGE plus quantitative PCR techniques
Fu Xiaohua , Li Yanli , Le Yiquan , Wang Lei.Quantitative analysis of dominant bacteria in environmental samples based on DGGE plus quantitative PCR techniques[J].Experimental Technology and Management,2012,29(9):45-47,50.
Authors:Fu Xiaohua  Li Yanli  Le Yiquan  Wang Lei
Institution:1(1.State Key Laboratory of Pollution Control and Resource Reuse,School of Environmental Science and Engineering,Tongji University,Shanghai 200092,China;2.State Key Laboratory of Marine Geology, Tongji University,Shanghai 200092,China;3.Shanghai Key Laboratory of Urbanization and Ecological Restoration,Shanghai 200062,China)
Abstract:
Keywords:
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