| SCAR分子标记监测菌群中的哈茨木霉(英文) |
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| 引用本文： | Gabriel PéREZ,Valentina VERDEJO,Clarissa GONDIM-PORTO,Julieta ORLANDO,Margarita CARú.SCAR分子标记监测菌群中的哈茨木霉(英文)[J].浙江大学学报(B卷英文版),2014(11). |
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| 作者姓名： | Gabriel PéREZ Valentina VERDEJO Clarissa GONDIM-PORTO Julieta ORLANDO Margarita CARú |
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| 基金项目： | Project supported by the Chilean National Fund for Scientific and Technological Development(FONDECYT)(No.1120508) |
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| 摘 要： | 研究目的:开发具有种属特异性序列特征性扩增区域(SCAR)标记物来监测哈茨木霉在其入侵的试验菌群中的定殖和生长,为哈茨木霉应用于生物防治等生态和生物技术中提供支撑。创新要点:多种木霉属真菌能与各种微观和宏观的生物有机体建立相互作用。利用这些相互作用,木霉可做为原生种群的入侵物种而用于生物防治。本文通过使用试验菌群为研究模型,利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术和序列特征性扩增区域(SCAR)标记物来监测菌群中哈茨木霉的生长状态。研究方法:利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,从16个10聚体引物进行多态性筛选,其中1个引物扩增出对应哈茨木霉的条带。对该条带进行克隆测序,并设计5个20–23聚体引物。成功利用引物对2F2/2R2和2F2/2R3278分别特异性地扩增出哈茨木霉BpT10a菌株278 bp和448 bp的DNA片段。同时,用这两个引物对14个哈茨木霉菌株和几种不同的真菌菌株进行特异性对照试验,也只成功扩增出哈茨木霉菌株。此外,使用真菌DNA混合物和试验真菌群的DNA为模板,采用实时聚合酶链式反应(PCR)对引物对2F2/2R2进行评估。当仅使用100份SCAR标记物或哈茨木霉仅占整个菌群的0.1%时,仍能检测出哈茨木霉。重要结论:本研究所建立的SCAR分子标记能有效监测菌群中的哈茨木霉的定殖和生长,具有较高特异性、灵敏度和准确度。
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| 关 键 词： | 哈茨木霉 序列特征性扩增区域(SCAR) 分子标记 试验菌群 |
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