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大豆花叶病毒杭州分离物基因组全序列测定及其结构分析
引用本文:黎昊雁,陈炯,陈剑平.大豆花叶病毒杭州分离物基因组全序列测定及其结构分析[J].科技通报,2003,19(2):90-93.
作者姓名:黎昊雁  陈炯  陈剑平
作者单位:1. 浙江大学生命科学学院,浙江,杭州,310029;浙江省农业科学院病毒室,浙江,杭州,310021
2. 浙江省农业科学院病毒室,浙江,杭州,310021
基金项目:浙江省青年科技人才专项资金(RC9604),浙江省重点实验室专项基金(001107557),浙江省科技厅重大攻关项目(011102181)
摘    要:测定了大豆花叶病毒杭州分离物(SMV-HZ)的基因组全序列。该病毒基因组全长9588个核苷酸,3‘末端具poly(A)尾,包含单一开读框,编码一个350.07kD的多聚蛋白。基因组全序列与美国SMV G2、G7、N株系及我国黄淮5号株系(Y5)的核苷酸同一性分别为93%、93%、94%和96%。多聚蛋白酶解后产生马铃薯Y病毒属典型的10成熟蛋白。SMV-YZ与G2、G7、N的不同成熟蛋白间的氨基酸同一性为89%-100%;SMV-HZ与Y5的不同成熟蛋白间氨基酸同一性则较高,达97%-100%。多重分析显示了SMV-HZ与G2、G7、N、Y5之间的序旬差异,G2、G7的P1蛋白氨基酸序列明显不同于其他株系,对SMV-HZ与我国其他株系。对SMV-HZ与我国其他分离物也进行了序列比较,对CP蛋白氨基酸序列的系统进化树分析表明SMV-HZ与BJ分离物的亲缘性最高。

关 键 词:大豆花叶病毒  核苷酸序列  基因组结构  变异
文章编号:1001-7119(2003)02-0090-04
修稿时间:2002年2月28日

Molecular Characterization of a Soybean Mosaic Virus Isolate from Hangzhou, China
Abstract:
Keywords:soybean mosaic virus  nucleotide sequence  genome organization  variation
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