大豆花叶病毒杭州分离物基因组全序列测定及其结构分析 |
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引用本文: | 黎昊雁,陈炯,陈剑平.大豆花叶病毒杭州分离物基因组全序列测定及其结构分析[J].科技通报,2003,19(2):90-93. |
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作者姓名: | 黎昊雁 陈炯 陈剑平 |
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作者单位: | 1. 浙江大学生命科学学院,浙江,杭州,310029;浙江省农业科学院病毒室,浙江,杭州,310021 2. 浙江省农业科学院病毒室,浙江,杭州,310021 |
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基金项目: | 浙江省青年科技人才专项资金(RC9604),浙江省重点实验室专项基金(001107557),浙江省科技厅重大攻关项目(011102181) |
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摘 要: | 测定了大豆花叶病毒杭州分离物(SMV-HZ)的基因组全序列。该病毒基因组全长9588个核苷酸,3‘末端具poly(A)尾,包含单一开读框,编码一个350.07kD的多聚蛋白。基因组全序列与美国SMV G2、G7、N株系及我国黄淮5号株系(Y5)的核苷酸同一性分别为93%、93%、94%和96%。多聚蛋白酶解后产生马铃薯Y病毒属典型的10成熟蛋白。SMV-YZ与G2、G7、N的不同成熟蛋白间的氨基酸同一性为89%-100%;SMV-HZ与Y5的不同成熟蛋白间氨基酸同一性则较高,达97%-100%。多重分析显示了SMV-HZ与G2、G7、N、Y5之间的序旬差异,G2、G7的P1蛋白氨基酸序列明显不同于其他株系,对SMV-HZ与我国其他株系。对SMV-HZ与我国其他分离物也进行了序列比较,对CP蛋白氨基酸序列的系统进化树分析表明SMV-HZ与BJ分离物的亲缘性最高。
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关 键 词: | 大豆花叶病毒 核苷酸序列 基因组结构 变异 |
文章编号: | 1001-7119(2003)02-0090-04 |
修稿时间: | 2002年2月28日 |
Molecular Characterization of a Soybean Mosaic Virus Isolate from Hangzhou, China |
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Abstract: | |
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Keywords: | soybean mosaic virus nucleotide sequence genome organization variation |
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