MCL-1及其BH3 螺旋结合自由能计算研究蛋白-蛋白相互作用原理 |
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作者姓名: | 刘广 李良 赵润宁 陈杭 李丹 韩聚广 |
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作者单位: | 中国科学技术大学核科学技术学院国家同步辐射实验室, 合肥 230029 |
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基金项目: | Supported by 973 Fund of Chinese Ministry of Science and Technology(2010CB934504) and NSFC(11179035) |
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摘 要: | MCL-1蛋白是细胞增殖和分化的一个关键调控因子. 使用MM-PBSA方法预测MCL-1蛋白与其野生型和碳氢化合物钉子修饰的BH3多肽形成的2个复合物的结合自由能. 结果表明,碳氢化合物钉子对多肽与MCL-1的亲和力影响有限; 并利用自由能分解(BFED)计算部分残基的能量贡献. 疏水效应是稳定复合物结构的主要因素,它同时被额外的静电相互作用强化. 该研究在原子水平上探究蛋白-蛋白相互作用机理,提供了新的癌症治疗候选药物.
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关 键 词: | MCL-1 细胞凋亡 分子动力学模拟 |
收稿时间: | 2011-04-22 |
修稿时间: | 2011-06-07 |
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