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| ABEEMσπ模型中计算分子电荷分布加速方法的比较 | |
| 引用本文： | 杨忠志,马丽.ABEEMσπ模型中计算分子电荷分布加速方法的比较[J].商丘师范学院学报,2014(6):1-6. |
| 作者姓名： | 杨忠志 马丽 |
| 作者单位： | 辽宁师范大学化学化工学院; |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(No.21133005) |
| 摘 要： | 基于ABEEMσπ模型计算分子的电荷分布时,求解线性方程组是最为耗时的环节.本文针对不同硬件环境下,系数矩阵是稠密、对称非正定矩阵的线性方程组的求解方法进行了比较.详细介绍了串行求解库LAPACK以及基于GPU的CULA库的使用,并给出了基于Bunch-Kaufman方法的串行改进算法以及MPI多机并行求解方法,并分别给出了几种方法的运行时间.用户可以根据不同的硬件条件选择不同的加速算法,以求解系数矩阵是对称非正定矩阵的线性方程组,进而加快分子体系中电荷分布的计算速度. |
| 关 键 词： | ABEEMσπ模型 MPI GPU LAPACK CULA 对称非正定矩阵 |
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