| 基于多位点连锁度量的标签SNP选择方法研究 |
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| 引用本文： | 贺永恒,赵磊,唐德权.基于多位点连锁度量的标签SNP选择方法研究[J].湘南学院学报,2015(2). |
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| 作者姓名： | 贺永恒 赵磊 唐德权 |
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| 作者单位： | 湖南警察学院 信息技术 网监 系,湖南 长沙,410138 |
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| 摘 要： | 针对标签SNP选择过程中存在时间复杂度高、重构准确度低以及缺乏生物含义等不足，本文提出了一种基于多位点连锁不平衡的标签SNP选择方法，该方法首先利用最小等位基因频率等指标对数据集进行预处理，排除噪声位点等，然后根据标签SNP选择过程的特点设计并改进了蚁群算法，以获取候选标签子集，最后，为了进一步提高重构准确度，本文以重构准确度为目标，利用支持向量机作为学习模型，采用后向淘汰策略对候选标签子集进行精选。实验结果表明，先过滤再精选的策略，不仅降低了时间复杂度，而且在样本重构准确度也有一定程度优势。
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| 关 键 词： | 单核苷酸多态性 蚁群算法 支持向量机 |
A Tag SNP Selection Method Based on Multiple Loci Linkage Disequilibrium |
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| He Yongheng,Zhao Lei,Tang Dequan.A Tag SNP Selection Method Based on Multiple Loci Linkage Disequilibrium[J].Journal of Xiangnan University,2015(2). |
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| Authors: | He Yongheng Zhao Lei Tang Dequan |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | SNP ant colony algorithm support vector machine |
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