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目前使用机器学习方法对稀有的PPII二级结构进行预测工作还比较少见.本文在分析数据集的特征基础之上,采用加强局部信息的改进编码方法,并使用生物信息学中常用的BP神经网络来预测PPII二级结构.通过对不同输入窗口长度与不同隐层节点数的神经网络进行训练和测试,得出在输入窗口长度为5个氨基酸残基和隐结点数为8时PPII螺旋结构能够被很好地预测出来,此时的预测敏感度为82.5%. 相似文献
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针对〈计算机文化基础〉课程教学中存在的几个问题,提出一些解决办法,力求达到提高教学效果,在教学中培养学生的合作精神,增强学生的自学能力、实际动手能力和创新能力. 相似文献
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PPII螺旋结构是一种重要的蛋白质二级结构类型.本文首先从2303条高质量的多肽链中提取出PPII螺旋结构形成结构数据集,然后对结构数据集进行了统计分析.统计表明:PPII螺旋结构是种稀有的蛋白质二级结构类型,约占数据集的2.1%,但是PPII螺旋结构经常出现在多肽链中,大约50%的蛋白链中至少包含一条PPII螺旋结构;PPII螺旋结构比较短,超过90%的PPII螺旋结构只有4个或5个氨基酸残基;PPII螺旋结构的长度分布与310螺旋很相似;PPII螺旋结构最偏爱Pro残基,但不是每条PPII螺旋结构都必须包含Pro残基,不过对于长度较长的PPII螺旋结构,一般至少包含一个Pro残基;另外,残基Gln,Thr,Ser和Leu在PPII螺旋结构中也较常出现;极性残基不常出现在PPII螺旋结构中;残基Gly最不倾向于PPII螺旋结构. 相似文献
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PPII螺旋结构是一种重要的蛋白质二级结构类型。本文首先从2303条高质量的多肽链中提取出PPII螺旋结构形成结构数据集,然后对结构数据集进行了统计分析。统计表明:PPII螺旋结构是种稀有的蛋白质二级结构类型,约占数据集的2.1%,但是PPII螺旋结构经常出现在多肽链中,大约50%的蛋白链中至少包含一条PPII螺旋结构;PPII螺旋结构比较短,超过90%的PPII螺旋结构只有4个或5个氨基酸残基;PPII螺旋结构的长度分布与310螺旋很相似;PPII螺旋结构最偏爱Pro残基,但不是每条PPII螺旋结构都必须包含Pro残基,不过对于长度较长的PPII螺旋结构,一般至少包含一个Pro残基;另外,残基Gln,Thr,Ser和Leu在PPII螺旋结构中也较常出现;极性残基不常出现在PPII螺旋结构中;残基Gly最不倾向于PPII螺旋结构。 相似文献
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基于改进编码的多聚脯氨酸二型结构预测 总被引：1，自引：0，他引：1
目前使用机器学习方法对稀有的PPII二级结构进行预测工作还比较少见。本文在分析数据集的特征基础之上,采用加强局部信息的改进编码方法,并使用生物信息学中常用的BP神经网络来预测PPII二级结构。通过对不同输入窗口长度与不同隐层节点数的神经网络进行训练和测试,得出在输入窗口长度为5个氨基酸残基和隐结点数为8时PPII螺旋结构能够被很好地预测出来,此时的预测敏感度为82.5%。 相似文献
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针对基本粒子群优化算法存在的早熟收敛问题,提出了一种保持粒子活性的改进PSO算法:当粒子失活时,对粒子进行变异或扰动操作,重新激活粒子,使粒子能够有效地进行全局和局部搜索,并将改进的PSO算法应用到酒精流加发酵过程的补料优化。实验结果表明,运用改进的PSO算法在进行流加发酵过程的补料优化时,它的寻优性能良好,而且寻优速度很快,可以提高最终产物14%的产量。 相似文献
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使用调和均值的KHM聚类算法,不像KM聚类算法,具有对初始值不敏感的优点。但它作为一个基于中心聚类算法,难以摆脱早熟收敛的问题。为了克服KHM算法的不足,本文提出结合ABC和KHM的ABC-KHM混合聚类算法。在混合算法中,聚类行为可以分为两个阶段:全局搜索的ABC聚类阶段和局部求精的KHM聚类阶段。通过仿真实验,并与KHM聚类算法进行了比较,结果表明:ABC-KHM混合聚类算法,不仅对聚类初始值不敏感,而且具有较快的聚类速度、良好的全局聚类效果,是一个不错的聚类算法。 相似文献
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计算机网络是一类实践性、应用性很强的课程.在分析了计算机网络实验教学现状的基础上,结合池州学院计算机网络课程实验教学的改革与实践,针对地方院校提出了网络类课程实验教学改革的思路,构建了面向应用型人才培养的实验教学体系. 相似文献
10.
计算机文化基础课程的教学思考 总被引：1，自引：0，他引：1
针对<计算机文化基础>课程教学中存在的几个问题,提出一些解决办法,力求达到提高教学效果,在教学中培养学生的合作精神,增强学生的自学能力、实际动手能力和创新能力. 相似文献