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非编码RNA参与了多种重要的生命进程,是当今研究的热点领域。在植物中,非编码RNA除了参与维持基因组的稳定,还在生长、发育、逆境胁迫反应等过程中发挥重要作用。RNA干扰(RNA interference,RNAi)是指由RNA触发的相应基因的表达抑制,是非编码RNA调控基因表达的一种重要的作用方式,自发现以来已逐渐发展为遗传分析、疾病治疗以及植物保护等方面的有效的新技术。文章重点介绍了微RNA(micro RNA,mi RNA)在植物抗虫防御中的生物学功能,si RNA对植物防御记忆的影响以及RNAi对植物防御信号途径的调节作用,同时阐述了RNAi在提高农作物抗虫性上的应用并展望了未来植物非编码RNA的研究方向。 相似文献
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为研究家蚕质型多角体病毒(BmCPV1)的遗传与变异、探讨S8片段的功能,通过RT-PCR克隆BmCPV1苏州株(BmCPV1-SZ)S8的cDNA,并对其核苷酸序列(GenBank登录号:GQ150539)和编码的氨基酸序列进行生物信息学分析.结果显示:S8由1328 bp构成,具有一个编码390个氨基酸残基的开放阅读框;在BmCPV1-SZ S8的编码氨基酸序列与BmCPV1-I和BmCPV1-H的一致性达93%,但与其他非CPV1型的相似程度较低;在推导的蛋白的氨基酸序列中间区域;具有E-丰富和P-丰富的区,域,其局部区域的氨基酸序列与某些蛋白的功能(细胞周期控制、蛋白降解和RNA降解)区域的序列具有一定的相似性;结构域家族分析显示,BmCPV1-SZ S8编码蛋白属GcrA家族,具有与DNA结合的HTH结构域.Blocks分析显示,S8编码蛋白同时具有DNA聚合酶家族、RNA聚合酶2的结构功能域;高级结构分类显示,S8编码蛋白具有与TIM桶酶、肽酶、核苷三磷酸水解酶相似的同源结构.推测该蛋白具有转录调控因子和多功能酶的功能.基于S8编码的氨基酸序列的进化分析显示,相同类型的CPV聚为一类,同一宿主不同类型的CPV相距较远,推测CPV主要根据其类型聚类,而宿主昆虫对聚类的影响相对较小. 相似文献
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miRNAs是一类存在于各种真核细胞内具有重要基因调控功能的非编码小分子RNA,是近年来生命科学与基础医学研究的热点领域。本文以汤森路透公司(Thomson Reuters)的科学引文索引数据库(SCIE)为数据源,利用Thomson Data Analyzer软件对1993—2013年发表的miRNAs相关研究论文进行文献计量分析,初步揭示了该领域的进展状况及发展趋势。 相似文献
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植物为什么会在不同季节开花?英国研究人员发现其秘密在于一种核糖核酸(RNA)起到了调控作用。英国约翰·英尼斯中心的研究人员发现的这种核糖核酸名为COOLAIR,是一种反义长链非编码核糖核酸。长链非编码核糖核酸曾被认为没有用,现在科学家发现它能发挥很多重要的功能,比如影响基因的表达和染色质沉默等。不过目前还不清楚其自身被调控的机理。研究人员以模式植物拟南芥作为研究对象,通过遗传筛选和基因克隆等手段,发现COOLAIR受到一种叫做R环的特殊结构的影响。R环是由一条脱氧核糖核酸(DNA)与核糖核酸杂合链以及一条单链DNA所形成的特殊基因组结构,一般在基因表达转录核糖核酸时可 相似文献
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《科技通报》2016,(1)
在1株污染半夏组培苗的枝状枝孢真菌(Cladosporium cladosporioides DF15)中检测到5条双链RNA(double-strand RNA,ds RNA)条带。通过M-SPAT(modified single-primer amplification technique)、克隆测序获得5条ds RNA的序列信息,分别为ds RNA1(2434bp)、ds RNA2(2241bp)、ds RNA3(2008bp)、ds RNA4(1261bp)和ds RNA5(942bp)。经Blast比对,ds RNA1编码蛋白的氨基酸序列与侵染荚孢壳科、球腔菌科真菌的双分病毒属(Partitivirus)病毒,以及侵染辣椒等植物的双分病毒科(Partitiviridae)病毒的依赖于RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,Rd Rp)序列相似度最高。氨基酸序列系统进化树分析表明,ds RNA1与侵染真菌的双分病毒属病毒亲源关系更近。通过核苷酸序列5'非编码区(untranslated regions,UTR)的比对发现,5条ds RNA的5'UTR序列相似度高达50.0%~95.3%,并含有2段保守序列5'-GUAAAUAAACCUU-3'和5'-C(/G)TA(/AG)CAAGT(/C)AT-3'。根据上述分析,推测5条ds RNA序列来自同1种病毒基因组,并且为侵染C.cladosporioides的1种新双分病毒科双分病毒属病毒,命名该病毒为C.cladosporioides virus 1。 相似文献
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<正>MicroRNA(miRNA)是一类进化上保守的,长度约22个核苷酸的内源性单链非编码小分子RNA。它能通过与靶mRNA特异的碱基配对引起靶mRNA的降解或翻译抑制,从而对基因进行转录后的表达调控。目前普遍认为miRNA在细胞的分化、增殖和凋亡,个体的发育,机体的代谢,病毒的易感性等多种疾病中都发挥着重要的作用[1],近年来的研究表明,miRNA在乳腺癌的发生发展中也有着密切的关系,本文就miRNA及其在乳腺癌发生发展中的作用进行叙述。 相似文献
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《科技通报》2018,(10)
HULC(highly upregulated in liver cancer)属lncRNA(长链非编码RNA),调控细胞自噬,在肝癌组织中高度上调表达。本文利用生物信息学数据库和实时荧光定量PCR技术对三唑磷处理后斑马鱼中lncRNA HULC调控机制进行研究,进一步了解lncRNA-miRNA-mRNA的调控网络,并且深入了解农药三唑磷对斑马鱼的环境毒理影响。基于芯片技术检测HTT、HOTTIP、NEAT1、NPPA和HULC的表达情况,三唑磷处理斑马鱼前后HTT表达无差异,HOTTIP表达略微下调,NEAT1、NPPA和HULC出现明显上调表达。软件RegRNA 2.0预测出dre-miR-2185*等7条miRNA与HULC发生相互作用,进一步预测其调控靶基因,构建调控网络。荧光定量PCR结果表明,HULC表达上调1.5倍、dre-miR-2185*表达下调6.63倍和离子型谷氨酸受体基因gria1a表达下调2倍。同时三者都可作为生物标志物来监测化学物质对环境和生物体的影响,以期对肝癌等相关疾病提供新的治疗方法。 相似文献
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分子以及分子间的相互作用是生命活动的基础,细胞是最小的生命单位。近年来在基因组、非编码蛋白质的RNA与表观遗传调控、合成生物学、活体细胞的结构与细胞内分子相互作用、胚胎干细胞的研究、纳米技术与分子细胞生物学的交叉结合等方面进展很快。本文就这些方面做一介绍并就国内今后的发展提出了建议。 相似文献
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猪瘟是一种高传染性和致死性疾病,猪瘟的病原物猪瘟病毒(CSFV)属于黄病毒科瘟病毒属,它是单股正链RNA病毒,全长约12.3kb,包括5′、3′非编码区(UTR)和一个开放阅读框(ORF),CSFV基因组首先翻译成一个多聚蛋白前体。前体聚蛋白在宿主和病毒的蛋白酶共同作用下被切割成为12个具有独立功能的蛋白,其中包括8种非结构蛋白。已有报道指出非结构蛋白NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B在病毒的复制中起着极为重要的作用,本文从CSFV非结构蛋白着手来阐述近些年有关CSFV非结构蛋白功能的研究进展,同时提出了存在的问题和展望,为猪瘟病毒非结构蛋白功能及猪瘟病毒致病机理分子机制的研究提供理论基础。 相似文献
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人类疾病的基因治疗 总被引:1,自引:0,他引:1
基因是细胞内遗传物质的功能单位。脱氧核酸(DNA)是基因的物质基础。DNA分子上排列着各种不同基因,构成人体基因组。它携带着细胞内的所有蛋白质的遗传信息,编码支配细胞生长、分化的一切指令。因此,在生命过程中它起着主宰的作用。遗传信息按分子生物学的中心法则传递和表达。即DNA的脱氧核苷酸序列忠实地被拷贝成相应的核苷酸序列信使RNA(mRNA)。这个过程叫做基因转录。然后,再以mRNA为模板翻译成具有相应氨基酸序列的蛋白质,此过程叫做基因翻译。上述转录和翻译过程就是所谓的基因表达。基因表达受多种因素调控,只有在适当的时间和部位表达适当量的蛋白质才能发挥其正常功能作用, 相似文献