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网上生物信息学数据库资源 总被引：21，自引：0，他引：21
大量的蛋白质和核酸数据的积累与理性地分析这些数据中所蕴涵的生物学意义的双重需要 ,产生了综合生物学研究与计算技术研究等领域最新成果的交叉性学科生物信息学。本文分别从生物信息学的基因组数据库 ,核酸和蛋白质一级结构序列数据库 ,生物大分子 (主要是蛋白质 )三维空间结构数据库 ,以及以这 3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库 (包括基因组二次数据库、蛋白质序列二次数据库、蛋白质结构二次数据库 )和生物信息学数据库的集成系统等几个方面 ,概述了发展中的生物信息学数据库的最近动态和有关信息 ,同时对主要的热门生物信息学数据库站点和资源进行了评价。此外 ,就国内生物信息学数据库存在的问题与前景进行了讨论 ,指出生物信息学将是一次国际性的科学大协作 ,也是我国生命科学振兴的一个新契机。 相似文献
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生物信息学数据库资源建设 总被引：4，自引：0，他引：4
大量的蛋白质和核酸数据的积累与理性地分析这些数据中所蕴涵的生物学意义的双重需要,产生了综合生物学研究与计算技术研究等领域最新成果的交叉性学科生物信息学。分别从生物信息学的基因组数据库,核酸和蛋白质一级结构序列数据库,生物大分子(主要是蛋白质)三维空间结构数据库,以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库包括基因组二次数据库、蛋白质序列二次数据库、蛋白质结构二次数据库,生物信息学数据库的集成系统等几个方面,概述了发展中的生物信息学数据库的最近动态和有关信息,同时对主要的热门生物信息学数据库站点和资源进行了评价。此外,就国内生物信息学数据库存在的问题与前景进行了讨论,指出生物信息学将是一次国际性的科学大协作,也是我国生命科学振兴的一个新契机。 相似文献
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专利查新与因特网免费生物信息学数据库的利用 总被引：6，自引：0，他引：6
随着因特网免费信息数据库的日益丰富，给专利查新工作带来了新的机遇与挑战。通过对网络生物信息学资源特点，Internet著名免费生物序列数据库检索利用，以及免费数据库与商用数据库的比较，对生物序列专利查新工作进行了有益的探讨。 相似文献
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自20世纪80年代第一个核酸和蛋白质序列数据库类似性检索方法发表以来,序列类似性检索成为核酸和蛋白质测序之后的常规操作,序列类似性检索方法也成为序列生物信息学分析的一种基本方法。在序列类似性检索方面已开发研制了多种不同的应用软件,如BLAST、FASTA、Search等,其中BLAST是最常用的检索软件之一。国内的科研人员大多凭经验利用BLAST进行序列类似性检索,未对其检索方法进行全面系统的研究。 相似文献
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为了有效地实现信息资源的交换和共享 ,很多国际知名的实验室和研究机构均建立了各种蛋白质相关数据库。相对蛋白质序列数据库而言 ,蛋白质双向凝胶电泳 ( Two-dimensional gel electrophoresis,2 DE)图谱数据库分布比较分散。本文介绍了发布蛋白质 2 DE数据的主要研究机构 ,分门别类地作了综合性、哺乳类、植物类、微生物和真菌类等专业蛋白质 2 DE数据库的数据内容、特色评价 ,并对两个 2 DE专业搜索引擎的数据来源、检索功能等方面作了描述与评价。本文最后提出 ,今后蛋白质 2 DE数据库的建设过程中应加强数据的标准化、图谱显示格式的统一化 相似文献
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邓菲 《现代图书情报技术》2005,21(5):68-70
以鳜鱼基因克隆为例，揭示了基于生物信息学的知识发现的全过程。利用Entrez、SRS等检索工具从GenBank、EMBL等核酸序列数据库、鱼类专业数据库获取相关鱼类的基因等信息，采用半经验值直观算法，以BLAST、FASTA方法结合Taxonomy分类数据库，选择恰当的过滤程序过滤掉效数据，最终获得与知识发现预期结果一致知识。 相似文献
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李轶 《中华医学图书馆杂志》2008,(5):49-51
GenBank数据库是世界上著名的生物信息数据库,包含了目前所有已知的核苷酸序列和蛋白质序列以及与它们相关的文献著作和生物学注释。详细介绍了它的Entrez检索功能。 相似文献
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迈向21世纪的生物信息学 总被引：4，自引：0，他引：4
白胜欣 《中华医学图书馆杂志》2001,10(5):1-1,48
生物信息学是一门新兴交叉学科，被称为21世纪生物技术的核心。介绍生物信息学的概念、分类、应用和重要的生物信息学数据库，并对生物信息学的发展进行展望，指出生物信息学正处在科学发展的前夜。随着20世纪末生物学数据和信息的大量积累，21世纪必将导致科学上的重大发现。 相似文献
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文章深化国内外领域数据库的FAIR原则实践研究,奠定进一步开展科学数据的管理工作布局与实践基础,为不同学科领域的数据开放路径提供支持。采用文本分析法对国内外11个生物信息学领域数据库的介绍文献内容进行编码,探索其FAIR原则实践进展。通过分析生物信息学领域数据库的可发现、可访问、可互操作和可重用的FAIR原则实践,发现FAIR原则在生物信息学领域的数据实践研究中存在管理与应用两方面的不足。建议在后续FAIR原则实践中,生物信息学领域数据库应创新设计和规范管理标准,丰富领域数据相关描述,遵循通用且符合FAIR原则的数据库规定,实现领域中各数据库平台的互联互通,提高数据开放共享水平。 相似文献
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我国信息资源系统建设中的几个问题 总被引：1，自引：0，他引：1
根据统计，目前我国已经拥有具有一定容量、能对外提供服务、自建的数据库１０００多个。其中，自然科学数据库（不包括图书、情报、环境与管理等）占总数的４８％，经济类数据库占２９％。我国数据库建设取得了可喜的成绩，但还存在以下不足：从数据库内容上看，社会急需的实用性强的商业、金融、物资、经济类数据库依旧缺乏；我国的数据库大多数为二次信息，以目录文摘为主缺乏一次文献信息；我国数据库规模很小，无论在数量、容量上还是在产值上，形不成规模效益；数据库结构与配置分布不合理；在数据库建设方面没有总体规划与重点支持数… 相似文献
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论我国全文数据库的开发与利用 总被引：1，自引：0，他引：1
论我国全文数据库的开发与利用陈能华全文数据库也就是一次文献数据库，即将原始文献整个进行信息化，转换成机器可读形式。图书馆与情报机构是无法做这一工作的，只能根据原始文献进行浓缩处理，建立二次文献数据库，也就是所谓的书目数据库。因为要将原始文献存入数据库... 相似文献
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基因库(GenBank)的电子邮件检索 总被引：3，自引：0，他引：3
基因库（GenBank）是由美国国立卫生研究院、美国国立医学图书馆以及美国国家生物技术信息中心建立发行的,所有已知核酸和蛋白质序列及其文献和生物学注释的公共数据库。可以通过WWW、FTP、E—mail获取其中的数据,本文主要介绍了查询服务器的检索方法。 相似文献
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邹素斌 《福建图书馆理论与实践》2004,(2):36-37
《数据库产业化生产优化模式的探讨》是福建省科委重大科技项目(2000H002)，我们所进行的《化学化工资源数据库建设及生产模式探讨》是其中的一个子项目。该数据库是应用数据库编程和数据收集整合的方法，通过对一次文献、二次文献等源数据的开发整合与转换，将其导入金纬达数据库检索系统中，实现对化学化工数据库多种途径的中英文检索， 相似文献
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科学数据与科学文献相关性研究——以生物信息学为例 总被引：1，自引：0，他引：1
科学数据的高速增长和科研工作者对信息获取日益提升的需求,要求科学数据库与科学文献库能实现集成信息服务,达到跨异构库知识发现的目的.本文以生物信息学为例,重点研究了生物信息学科学数据库与文献库的两种相关关系:外部关联和内部关联.前者主要是基于两者的外部相似性建立的交叉引用关系,后者则在内容层面直至知识层面实现两者的聚合和知识关联. 相似文献
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试论建立大规模的全文数据库 总被引：6，自引：0，他引：6
周士虎 《现代图书情报技术》1996,12(3):20-23
分析了当前二次文献库和引文数据库建设中存在的问题及其内涵, 指出出版印刷本的二次文献库和引文数据库是一种重复劳动。列举了全文数据库的优点, 对建设大规模全文数据库的可行性、对计算机系统的要求、文献情报工作者的任务、建设和服务中可能产生的问题等作了分析。认为建设大规模全文数据库的时机已成熟, 应该着手其实施与实际的操作。 相似文献
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利用SCI数据库检索出有关蛋白质组学研究的5896篇论文,并进一步利用SCI数据库提供的结果分析功能,从作者、期刊、出版年限、学科、机构及国家角度,对5896篇论文进行了统计分析。在此过程中,系统地阐述了SCI数据库的结果分析功能对学术研究的重要作用。 相似文献
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《科技与出版》2008,(4):60-61
一,蛋白质研究 随着人类基因组图谱的公布,以及诸多动物、植物、微生物的基因组全序列测定的完成,生物科学进入了"基因组时代".人类将在了解遗传物质DNA全部序列的基础上研究和认识生命的奥秘.阐明基因编码的产物--蛋白质的功能已成为主要研究目标.蛋白质是最主要的生命活动载体和功能的执行者,对蛋白质复杂多样的结构功能、相互作用和动态变化的深入研究,将在分子、细胞和生物体等多个层次上全面揭示生命现象的本质.同时,蛋白质科学研究成果将催生一系列新的生物技术产品,带动医药、农业和绿色产业的发展,引领未来生物经济.蛋白质科学已成为各国争夺的生命科学制高点. 相似文献
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