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21.
PPII螺旋结构是一种重要的蛋白质二级结构类型.本文首先从2303条高质量的多肽链中提取出PPII螺旋结构形成结构数据集,然后对结构数据集进行了统计分析.统计表明:PPII螺旋结构是种稀有的蛋白质二级结构类型,约占数据集的2.1%,但是PPII螺旋结构经常出现在多肽链中,大约50%的蛋白链中至少包含一条PPII螺旋结构;PPII螺旋结构比较短,超过90%的PPII螺旋结构只有4个或5个氨基酸残基;PPII螺旋结构的长度分布与310螺旋很相似;PPII螺旋结构最偏爱Pro残基,但不是每条PPII螺旋结构都必须包含Pro残基,不过对于长度较长的PPII螺旋结构,一般至少包含一个Pro残基;另外,残基Gln,Thr,Ser和Leu在PPII螺旋结构中也较常出现;极性残基不常出现在PPII螺旋结构中;残基Gly最不倾向于PPII螺旋结构.  相似文献   
22.
分析了生物信息学的内涵、主要内容、研究方向和面临严峻的挑战;探讨了生物信息学的主要研究方法:动态规划算法、启发式方法、聚类分析、机器学习方法、非参数统计、建模和仿真、序列分析软件包、生物信息数据库、序列对位排列方法等。还专门分析了生物信息学的新兴研究方法——大数据分析方法产生的背景、突出特点和适用于生物信息学研究的具体方法技术。  相似文献   
23.
深圳华大基因研究院云计算平台始终是强而有力的支撑性平台,与世界一流的测序技术平台共同构成了BT+IT的双驱动模式,进而加强基因组技术在基础生命科学、基因检测、药物研发、个性化医疗、新能源、农业、环境等领域的广泛应用,加速相关产业发展。华大基因生物信息云计算实验室以实现超大规模的生物信息学计算为核心任务,研发高效能计算、弹性云计算、生物数据中心和生物云计算等技术,为海量生物信息学数据的存储、处理和分析提供了稳定而高效的保障。  相似文献   
24.
生物信息学作为新兴的交叉学科,已经成为生物学研究的强有力的辅助工具之一。本文针对目前非专业研究生生物学信息学教学实践中的一些问题,提出在教学目的、教学内容、教学方法方面的思考,希望能够有助于推动非专业研究生生物信息学课程教学的开展。  相似文献   
25.
生物信息学研究需要使用先进的计算工具处理大量生物的模糊的和不确定的数据。群智能优化算法以低成本、快速和准确合理地解决复杂的搜索问题的优点,使其成为一族能用以较好地解决生物信息学中的问题的启发式算法。综述群智能优化算法及其在生物信息学问题中的应用。  相似文献   
26.
为了改善《数据结构》课程的教学效果,提高学生的学习兴趣,将生物信息学中的一些案例按照其涉及的数据结构原理,引入到《数据结构》教学之中。其中,典型案例包括串联重复序列中的基因识别问题、双序列比对的动态规划算法和多序列比对中寻找折中序列的问题。教学实践表明,引入生物信息学案例能使学生加深对相关算法的理解。  相似文献   
27.
Re + search     
李川昀 《大学生》2013,(Z2):124-125
正本期关键词:科研方法不管是位于科学前沿的交叉学科,还是相对传统的基础学科,要想取得突破和成绩,除了勤奋努力,科研方法和思路是关键。"本科的大实验根本就不能叫科研,所有的条件都是前人摸索好的,你需要做的只是让结果重现;而科研是在一点点摸索全新的东西,很多细节的地方不注意的话都会导致失败。"这句话对我的影响很大,从那以后,我进一步加深了对科研的认识:research意味着要re search!  相似文献   
28.
GenBank数据库是世界上著名的生物信息数据库,包含了目前所有已知的核苷酸序列和蛋白质序列以及与它们相关的文献著作和生物学注释。详细介绍了它的Entrez检索功能。  相似文献   
29.
以芥菜(Brassica juncea)中具有抗逆作用的植物蛋白磷酸酶PP2A为例,对其进行了生物信息学的初步分析。预测了PP2A的一级结构,二级结构及其基本性质。为生物信息学在研究抗逆蛋白中的应用提供了方法参考,为进一步研究PP2A在抗逆生理中的功能提供了有用的理论依据。  相似文献   
30.
生物信息学教学模式初探   总被引:5,自引:0,他引:5  
生物信息学是生物科学中一门新兴的前沿学科。本文针对目前国内生物信息学教学现状,借鉴其他学科成熟的教学模式,结合生物信息学的课程特点,提出了“以知识为中心,理论教学与实验教学有机结合”的教学模式。  相似文献   
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