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1.
建立并优化虎耳草ISSR-PCR反应体系和扩增程序,为探讨虎耳草种质资源遗传多样性奠定基础.采用正交设计方法和单因子试验,研究TaqDNA聚合酶、dNTP、Mg2+、引物、模板DNA、延伸时间及循环次数对PCR扩增的影响.结果表明:虎耳草ISSR-PCR的最佳反应体系为:在25μL的反应体系中含模板DNA 35ng,Mg2+1.25mmo/lL、dNTP 380μmo/lL、引物1.2μmo/lL、Taq DNA聚合酶1.5U.反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性1min,50℃(据不同引物的退火温度)退火70s,72℃延伸1.5min,40个循环;72℃延伸10min,4℃保存.经过11份虎耳草种质检验,证明该体系稳定可靠,可用于虎耳草种质资源遗传多样性分析及居群鉴别的研究. 相似文献
2.
采用改良的SDS法提取黄瓜种子基因组DNA,并以其为模板对影响RAPD扩增反应的主要因子采用单因素递进分析方法进行优化,建立了黄瓜种子基因组DNA最佳RAPD反应体系,即20 μl的反应体积中含有60ng模板,1.2U Taq DNA聚合酶,3.0 mmol/L MgCl2,0.20 mmol/L dNTP,1.40 μmol/L引物. 相似文献
3.
《南阳师范学院学报》2018,(3):21-25
利用ISSR标记对14个月季品种进行遗传多样性分析.正交设计确定20μL最佳ISSR-PCR反应体系,筛选7条引物对14个月季品种的基因组DNA进行ISSR-PCR扩增.7条引物共扩增出60条DNA条带,多态性位点52个,多态性位点百分率为86.0%,品种间遗传一致度为0.500.85.UPGMA聚类显示,藤本月季与大花月季和微型月季存在不同程度的亲缘关系.月季品种间的遗传多样性较高,大花月季、藤本月季和微型月季的品种类群间可能发生过杂交和基因交换. 相似文献
4.
以改进SDS法抽提濒危植物水杉嫩叶总DNA,进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析,分别测试了镁离子,dNTP,模板DNA含量,引物和DNA聚合酶量对反应结果的影响,通过各因子的组合研究,可知水杉RAPD分析较适宜的扩增条件是:15μlPCR反应体积,1×Taq酶配套缓冲液(10mmol/LTris HCl pH 9,0.50mmol/L KCl,0.1％Triton X-100),1.5mmol/L MgCl_2,0.5U Taq酶(上海华美公司),5ng模板DNA,20pmol引物(上海Sangon公司);2μg/μlBSA;dATP、dCTP、dGTP、dTTP各0.2mmol/L。 相似文献
5.
都支杜鹃ISSR扩增条件的优化 总被引：1，自引：0，他引：1
对珍稀濒危物种都支杜鹃的ISSR扩增体系中的Mg2+浓度、dNTP浓度、Taq酶含量和底物含量进行优化,并在优化后的基础上筛选出8条效果较好的引物,在梯度PCR仪中设置温度梯度,找到这些引物的最佳退火温度。优化结果表明,至少在一定的范围内底物浓度和Taq酶含量对PCR反应结果影响不大,相对而言,dNTP浓度和Mg2+浓度对反应结果的影响更加显著。优化后的15 ul PCR反应体系中包括20 ng模板DNA、0.3μM引物、1.5 ul Buffer(Mg2+free),0.5 U Taq酶、1.5 mM MgCl2和0.1 mM dNTP。 相似文献
6.
用SDS法提取了苜蓿基因组DNA的模板。从100个10bp的随机引物中筛选出了12条能在11个苜蓿品种中均能扩增出清晰的片段的引物。应用L16(45)正交表,研究了DNA、dNTPs、Mg2 、Taq酶和引物的浓度对扩增迁移率重现性的影响。用这种方法建立的苜蓿RAPD-PCR优化反应体系为:20μL体系中含DNA模板的浓度是5.0mg/L、dNTPs浓度是0.175mmol/L、Mg2 浓度是1.25mmol/L、Taq酶在20μL的体系中是1.00U、引物浓度是0.40μmol/L。 相似文献
7.
本研究以辣椒基因组DNA为模板,优化辣椒SRAP反应体系中的参数,建立了一套适用于辣椒的SRAP-PCR最佳反应体系。在25μL反应体系中,模板DNA 50 ng、上下游引物各0.1μmol/L、dNTPs 0.1mmol/L、Taq DNA聚合酶1.5 U、Mg2+浓度为2.0 mmol/L。扩增程序为:94℃3 min;94℃30 s、35℃30 s、72℃1.5 min,5 cycles;94℃30 s、54℃30 s、72℃30 s,35 cycles;72℃10 min,用2%琼脂糖凝胶电泳和8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测扩增结果。利用该优化体系筛选引物,筛选出条带清晰、重复性好的15对SRAP引物组合,验证了体系的实用性。 相似文献
8.
采用改进的CTAB法提取中国特有濒危裸子植物白豆杉(Pseudotaxus chienii)嫩叶总DNA,进行RAPD分析.分别研究了模板DNA、引物、dNTPs、Mg2 和TaqDNA聚合酶用量对RAPDPCR扩增反应结果的影响.筛选并建立了适合于白豆杉RAPD扩增的反应体系:总体积25μL,其中10×PCR缓冲液(500mmol/L KCl,100mmol/L Tris-HCl,1.0%Triton X-100,20mmol/L MgCl2)2.0μL,引物(1.5μmol/L)0.5μL,dNTPs(10mmol/L)0.4μL,模板1μL(35ng),Taq酶0.8μL(0.5U),水20.3μL. 相似文献
9.
采用改进的CTAB法提取中国特有濒危裸子植物白豆杉(Pseudotaxus chienii)嫩叶总DNA,进行RAPD分析.分别研究了模板DNA、引物、dNTPs、Mg2 和TaqDNA聚合酶用量对RAPD PCR扩增反应结果的影响.筛选并建立了适合于白豆杉RAPD扩增的反应体系:总体积25μL,其中10×PCR缓冲液(500 mmol/L KCl,100 mmol/L Tris-HCl,1.0%Triton X-100,20 mmol/L MgCl2)2.0μL,引物(1.5μmol/L)0.5μL,dNTPs(10 mmol/L)0.4μL,模板1μL(35 ng),Taq酶0.8μL(0.5 U),水20.3 μL. 相似文献
10.
以新疆哈密瓜为试验材料,利用正交试验设计研究了4个主要因子(Mg2+、DNA聚合酶、SSR引物和dNTP)对SSR扩增结果的影响,并对该哈密瓜SSR反应体系进行了优化,同时尝试用降落(Touchdown,TD)PCR方法扩增目的片段.最终筛选出如下最佳反应体系:总反应体积为25 μL,其中dNTP 200 μmol/L,SSR引物0.75μmol/L,Taq DNA聚合酶1.0 U,Mg2+ 1.5 mmol/L;降落PCR省却了常规PCR中摸索最适退火温度的过程,对一些Tm值相近的PCR反应可应用一套温度程序扩增,是一种行之有效的方法. 相似文献