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相似文献
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1.
采用改进的CTAB法提取中国特有濒危裸子植物白豆杉(Pseudotaxus chienii)嫩叶总DNA,进行RAPD分析.分别研究了模板DNA、引物、dNTPs、Mg2 和TaqDNA聚合酶用量对RAPD PCR扩增反应结果的影响.筛选并建立了适合于白豆杉RAPD扩增的反应体系:总体积25μL,其中10×PCR缓冲液(500 mmol/L KCl,100 mmol/L Tris-HCl,1.0%Triton X-100,20 mmol/L MgCl2)2.0μL,引物(1.5μmol/L)0.5μL,dNTPs(10 mmol/L)0.4μL,模板1μL(35 ng),Taq酶0.8μL(0.5 U),水20.3 μL.  相似文献   

2.
以改进SDS法抽提濒危植物水杉嫩叶总DNA,进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析,分别测试了镁离子,dNTP,模板DNA含量,引物和DNA聚合酶量对反应结果的影响,通过各因子的组合研究,可知水杉RAPD分析较适宜的扩增条件是:15μlPCR反应体积,1×Taq酶配套缓冲液(10mmol/LTris HCl pH 9,0.50mmol/L KCl,0.1%Triton X-100),1.5mmol/L MgCl_2,0.5U Taq酶(上海华美公司),5ng模板DNA,20pmol引物(上海Sangon公司);2μg/μlBSA;dATP、dCTP、dGTP、dTTP各0.2mmol/L。  相似文献   

3.
枇杷属植物RAPD反应体系的优化与应用   总被引:2,自引:0,他引:2  
采用CTAB—蛋白酶K法提取了48份枇杷种质的DNA,以西班牙枇杷品种Ullera为模板DNA,对枇杷属植物RAPD反应体系进行优化研究,结果表明:25μL反应体系中,Taq DNA聚合酶、Mg2+、引物、模板DNA和dNTPs等5种主要成分的适宜浓度或用量分别是:Mg2+为2.0 mmol/L,Taq DNA聚合酶为1.0 U,引物为0.25"mol/L,dNTPs为0.100—0.125 mmol/L,模板DNA为25—30 ng。利用该优化体系对48份枇杷种质进行RAPD随机扩增,经琼脂糖电泳获得了清晰的扩增图谱。  相似文献   

4.
用SDS法提取了苜蓿基因组DNA的模板。从100个10bp的随机引物中筛选出了12条能在11个苜蓿品种中均能扩增出清晰的片段的引物。应用L16(45)正交表,研究了DNA、dNTPs、Mg2 、Taq酶和引物的浓度对扩增迁移率重现性的影响。用这种方法建立的苜蓿RAPD-PCR优化反应体系为:20μL体系中含DNA模板的浓度是5.0mg/L、dNTPs浓度是0.175mmol/L、Mg2 浓度是1.25mmol/L、Taq酶在20μL的体系中是1.00U、引物浓度是0.40μmol/L。  相似文献   

5.
采用单因子梯度试验法对影响雷公藤RAPD—PCIK反应的Mg^2+浓度、dNTPs浓度、引物浓度、Taq DNA聚合酶的用量及DNA模板浓度进行了筛选。结果表明获得清晰、重复性高的雷公藤RAPD-PCR扩增条件为:20μL PCR反应体积中,2.0mmol·L^-1 MgCl2,0.2mmol·L^-1 dNTPs,0.2μmol·L^-1引物,50ng模板DNA,1UTaq DNA聚合酶。  相似文献   

6.
影响聚式酶链式反应实验效果的基本因素   总被引:1,自引:0,他引:1  
研究聚式酶链式反应(PCR)实验中影响其扩增效果的多种因素,寻求反应体系中理想的各因素浓度配比。选取含5+10优质亚基的小麦品种为材料,以特异扩增1DX5基因PCR实验为例,从模板DNA、引物终浓度、Taq酶、二价镁离子、4dNTPs混合液、缓冲液浓度几方面入手,通过设计梯度实验,研究不同因素对PCR扩增效果的影响。结果表明,反应体系6个基本因素,缺少任何1个都扩增不出产物。在反应总体积25μL的PCR反应体系中,模板DNA选用32 ng/μL,Mg2+终浓度2 mmol/L,Taq酶1.2 U/25μL,引物0.8μmol/μL,4dNTPs0.3 mmol/L,缓冲液1×buffer最为合适,能扩增出理想的结果。  相似文献   

7.
正交设计在梨基因组RAPD优化体系中的应用   总被引:2,自引:0,他引:2  
采用正交设计研究方法,建立了梨RAPD分析的PCR反应体系,成功地进行了RAPD扩增,筛选出梨RAPD的最佳方案为:25μl反应体系中包括引物0.5μmol.μL-1,dNTPs0.1mmol.L-1,模板DNA10ng,Taq酶1U,Mg2 4mmol.L-1,10buffer缓冲液2.5lμ,其余部分用无菌超纯水补平。PCR扩增循环为95℃3min,38℃1min,72℃2min1次循环;94℃1min,38℃1min,72℃2min,46次循环,最后72℃延伸10min。  相似文献   

8.
目的:对RAPD的反应体系进行优化,以期建立稳定的临床检测系统,在控制院内感染的流行病研究中发挥更大的作用.方法:用RAPD技术进行基因分型.结果:引物浓度:浓度为0.5μmol/L 时扩增最好.DNA模板:浓度在0.50ng/μl 、2ng/μl均得到了良好的扩增效果.镁离子浓度:在2.0mmol/L、4mmol/L时扩增效果较好.退火温度:在30℃时扩增条带最清晰.循环参数:在35、45个循环时扩增效果均好.结论:本试验对RAPD反应条件进行优化,建立了较稳定的临床检测体系.  相似文献   

9.
RAPD技术是一种新的分子标记技术,DNA质量是保证RAPD分析成功的关键。为获得高质量的木通属植物基因组DNA,本文采用SDS法、改良CTAB法、高盐低pH值法提取三叶木通总DNA。结果表明,高盐低pH值法不适用于木通属植物DNA的提取;改良CTAB法是合适的DNA提取方法,它们获得DNA模板纯度高、质量好,可直接用于RAPD分析。同时,对RAPD反应条件中的一些重要参数进行摸索和优化试验,建立适合木通属植物RAPD分析应用的体系,其组成为:反应液总体积为25μL,2.5μL 10×PCR缓冲液、0.16 mmol/L dNTPs2、.0 mmol/L Mg2 、0.64μmol/L引物、1 U/μL Taq酶4、0 ng/25μLDNA模板。PCR循环体系为:94℃,4 min-[-94℃,30 s-37℃,90 s-72℃,60 s-]-72℃,5 min,40个循环。  相似文献   

10.
以渐危植物海菜花基因组DNA为研究对象,筛选引物UBC-818[序列为(CA)8G]研究并确定了该引物适宜的退火温度,对影响ISSR扩增效果的主要参数进行筛选和优化,确定了海菜花的ISSR分析的最佳反应体系:15 μL反应体系中含25 ng模板DNA,0.2 mmol·L-1引物,0.2 μmol·L-1 dNTPs,2.0mmol·L-1 Mg2+ ,0.5 UTaq酶,1.5 μL 10×PCR Buffer Mg2+(-)[100 mmol·L-1 Tris-HCI(pH 8.3),500 mmol.L-1KCI].  相似文献   

11.
采用改良的SDS法提取黄瓜种子基因组DNA,并以其为模板对影响RAPD扩增反应的主要因子采用单因素递进分析方法进行优化,建立了黄瓜种子基因组DNA最佳RAPD反应体系,即20 μl的反应体积中含有60ng模板,1.2U Taq DNA聚合酶,3.0 mmol/L MgCl2,0.20 mmol/L dNTP,1.40 μmol/L引物.  相似文献   

12.
RAPD在蔬菜种子纯度鉴定中应用的反应条件优化   总被引:2,自引:0,他引:2  
随着分子生物学的发展,RAPD(随扩增多态性DNA)在越来越多的领域得到应用,但在蔬菜纯度鉴定方面,国内外报道较少,为了更好地将RAPD方法应用于蔬菜种子纯度鉴定,就反应条件进行了探索,以几种蔬菜种子为材料,使用进口PCR仪在,对几种蔬菜种子进行RAPD分子过程中,从DNA提取方法,模板DNA量,Mg^2+浓度,Taq-DNA聚合酶的量,dNTPs浓度,随机引物浓度及反应缓冲液的量等几个方面进行研  相似文献   

13.
都支杜鹃ISSR扩增条件的优化   总被引:1,自引:0,他引:1  
对珍稀濒危物种都支杜鹃的ISSR扩增体系中的Mg2+浓度、dNTP浓度、Taq酶含量和底物含量进行优化,并在优化后的基础上筛选出8条效果较好的引物,在梯度PCR仪中设置温度梯度,找到这些引物的最佳退火温度。优化结果表明,至少在一定的范围内底物浓度和Taq酶含量对PCR反应结果影响不大,相对而言,dNTP浓度和Mg2+浓度对反应结果的影响更加显著。优化后的15 ul PCR反应体系中包括20 ng模板DNA、0.3μM引物、1.5 ul Buffer(Mg2+free),0.5 U Taq酶、1.5 mM MgCl2和0.1 mM dNTP。  相似文献   

14.
红豆杉科及其相关类群的分支分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
对红豆杉科及其相关类群的127个来自不同分支学科的性状进行了分支分析,结果显示:①在红豆杉科中红豆杉属和白豆杉属亲缘关系比较近,穗花杉属和榧属比较近;②三尖杉科和红豆杉科组成了姐妹群关系;③我国所产的罗汉松科4属组成了一个单系类群,根据分析结果对红豆杉科各属以及相关类群的系统位置进行了讨论.  相似文献   

15.
在研究猪分子标记遗传距离同杂种优势的关系时,对模板浓度和纯度、引物浓度、dNTP浓度、Mg2+浓度、不同商标的Tag酶等影响RAPD扩增的因素进行了系统的分析,在此基础上建立了适宜于本实验室研究的最佳RAPD技术体系:25(1反应体系中,含10×buffer2.5(I,MgCl21.75mmol/L,dNTPO25mmol/L,引物0.24(mol/L,Tag酶2U,模板50~100ng,1(g/(IBSA。反应程序为:94℃预变性5min,然后94℃变性1min,36℃退火1min,72℃延伸2min40个循环,最后在72℃延伸10min。  相似文献   

16.
建立并优化虎耳草ISSR-PCR反应体系和扩增程序,为探讨虎耳草种质资源遗传多样性奠定基础.采用正交设计方法和单因子试验,研究TaqDNA聚合酶、dNTP、Mg2+、引物、模板DNA、延伸时间及循环次数对PCR扩增的影响.结果表明:虎耳草ISSR-PCR的最佳反应体系为:在25μL的反应体系中含模板DNA 35ng,Mg2+1.25mmo/lL、dNTP 380μmo/lL、引物1.2μmo/lL、Taq DNA聚合酶1.5U.反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性1min,50℃(据不同引物的退火温度)退火70s,72℃延伸1.5min,40个循环;72℃延伸10min,4℃保存.经过11份虎耳草种质检验,证明该体系稳定可靠,可用于虎耳草种质资源遗传多样性分析及居群鉴别的研究.  相似文献   

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