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《南阳师范学院学报》2018,(3):21-25
利用ISSR标记对14个月季品种进行遗传多样性分析.正交设计确定20μL最佳ISSR-PCR反应体系,筛选7条引物对14个月季品种的基因组DNA进行ISSR-PCR扩增.7条引物共扩增出60条DNA条带,多态性位点52个,多态性位点百分率为86.0%,品种间遗传一致度为0.500.85.UPGMA聚类显示,藤本月季与大花月季和微型月季存在不同程度的亲缘关系.月季品种间的遗传多样性较高,大花月季、藤本月季和微型月季的品种类群间可能发生过杂交和基因交换. 相似文献
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不同花色紫薇的ISSR分析 总被引：1，自引：0，他引：1
以ISSR标记技术,对不同花色的4个紫薇群体(红色紫薇群体、白色紫薇群体、紫色紫薇群体及粉色紫薇群体)共48个样品进行分析,筛选得到4个较好的特异性引物,共扩增出30个清晰的扩增位点,其中多态性位点23个,多态位点百分率为76.67%.利用POPGENE软件分析得到,四个紫薇群体间的Shannon's信息指数为0.4186,基因多样性指数(Ht)为0.2806,表明这四个紫薇群体具有较丰富的遗传多样性.聚类分析结果表明白色、紫色及粉色系的单株基本聚在一起,但红色系的聚类结果比较分散,且红色和白色亲缘关系较近,与粉色的亲缘关系较远. 相似文献
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《昆明师范高等专科学校学报》2014,(6)
为探明弥勒市8个主栽葡萄品种的亲缘关系,研究以这8个葡萄品种为材料,利用ISSR分子标记技术进行基因组多态性检测,从40条ISSR随机引物中筛选出10条用于ISSR扩增.结果显示,筛选出的这10条引物共扩增出81条谱带,其中66条为多态性谱带,多态性百分率较高,为79.9%;根据ISSR的扩增结果进行相似性系数分析,8个葡萄品种的遗传相似性系数在0.50~0.78之间,平均为0.647;通过UPGMA进行聚类分析,在遗传相似性系数为0.58处,8份试材分为2大类群,其中第1大类群包含3份欧美杂种品种和1份未知来源品种,第2大类群包含4份欧亚种品种.由此推测未知来源的这一品种属于欧美杂交种品种. 相似文献
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不同地区浒苔（Enteromorpha prolifera）群体遗传多样性的ISSR分析 总被引：3，自引：0，他引：3
通过ISSR分子标记技术对6个不同地区浒苔(Enteromorpha prolifera)群体(浙江鳌江、浙江宁波、广东南澳、江苏南通、福建福鼎、浙江南麂岛)进行了遗传多样性分析.结果显示,从100条ISSR引物中筛选出5条引物,共得到36个清晰的扩增位点,其中多态性位点10个;6个地区浒苔的多态位点比率为27.78%,平均杂合度为0.1256,Shannon's信息指数为0.1795;群体间的遗传距离在0.0870-0.2062之间,平均遗传距离为0.1654.研究表明,6个地区浒苔的遗传多样性处于较低水平,遗传变异相对贫乏;它们之间的亲缘关系与其地理距离的远近没有直接的关系,并揭示6个地区的浒苔是属于同一物种. 相似文献
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红树植物海桑简单重复序列区间(ISSR)条件的优化 总被引：17，自引：0，他引：17
海桑(Sonneratiacaseolaris(L.)Engler)是海桑科一种重要的红树植物.为利用ISSR分子标记研究海桑的遗传多样性,对影响ISSR PCR的多个因素,包括Taq酶的用量、Mg2+浓度和dNTP浓度、引物浓度及其退火温度、模板DNA浓度等进行研究,确定了海桑ISSR PCR分析的最适条件:10μLPCR反应体积中,10×buffer(100mmol·L-1KCl,80mmol·L-1(NH4)2SO4,100mmol·L-1Tris HCl,pH9.0,0.5%NP 40)1μL,0.35UTaq酶,2～3.75mmol·L-1Mg2+,300μmol·L-1dNTP,0.3μmol·L-1引物,10ng模板DNA. 相似文献
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《南阳师范学院学报》2019,(6):32-36
采用目标起始密码子多态性(SCoT)技术来分析16个月季品种的遗传多样性.通过对SCoT-PCR反应体系优化和PCR扩增程序探索,从55条SCoT分子标记引物中筛选出9条引物.品种间成对遗传相似度变幅介于0.400 0～0.775 0,9条SCoT标记引物的扩增多态性位点百分率为93.5%,显示月季品种间具有较丰富的遗传多样性.分析UPGMA聚类结果可知:16个月季品种在遗传相似性系数为0.62处被划分成2个聚类分支,第一分支又分为三个亚分支,显示不同月季品种间具有明显的遗传分歧,遗传关系复杂.大花月季、丰花月季与微型月季的亲缘关系相对较近,推测月季品种在驯化进程中存在基因重组和基因渐透现象;藤本月季进化独立,与其他园艺类群月季存在较明显的遗传分歧. 相似文献
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红树植物桐花树遗传多样性研究进展 总被引：1，自引：0，他引：1
李海生 《广东教育学院学报》2007,27(5):66-70
遗传多样性作为生物多样性的重要组成部分,是生态系统多样性和物种多样性的基础.桐花树是热带亚热带海岸红树林树种中的广布种之一,研究其遗传多样性具有重要的理论和实践意义.等位酶,ISSR、RAPD和AFLP等分子标记已用于桐花树的遗传多样性研究中.综述了此方面的研究进展.总体而言,桐花树在物种和种群水平上具有较高的遗传变异水平. 相似文献
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RAPD在蔬菜种子纯度鉴定中应用的反应条件优化 总被引：2，自引：0，他引：2
随着分子生物学的发展,ＲＡＰＤ（随扩增多态性ＤＮＡ）在越来越多的领域得到应用,但在蔬菜纯度鉴定方面,国内外报道较少,为了更好地将ＲＡＰＤ方法应用于蔬菜种子纯度鉴定,就反应条件进行了探索,以几种蔬菜种子为材料,使用进口ＰＣＲ仪在,对几种蔬菜种子进行ＲＡＰＤ分子过程中,从ＤＮＡ提取方法,模板ＤＮＡ量,Ｍｇ＾２＋浓度,Ｔａｑ－ＤＮＡ聚合酶的量,ｄＮＴＰｓ浓度,随机引物浓度及反应缓冲液的量等几个方面进行研 相似文献
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SSR和ISSR分子标记已广泛应用于研究遗传行为和基因定位。在对水稻早世代稳定遗传特性的研究中,选用分布于水稻12条染色体上的168对多态性较好的SSR引物,对28个稳定株系的F_1、F_2、F_3及同组合的分离株系进行了SSR标记分析；选用26个多态性较好的ISSR引物对5个组合中出现的8个稳定株系及同组合的分离株系进行了ISSR分子标记。结果显示：稳定株系的标记带型出现三种类型：(1)母本带出现,父本带消失；(2)父本带出现,母本带消失；(3)出现非父母标记带型。分离株系表现为杂合标记带。推测水稻早世代稳定是在遗传因子作用下,在杂交受精或合子早期发育中发生了双亲染色体重排,形成纯合的F_1单株。 相似文献
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采用改进的CTAB法提取中国特有濒危裸子植物白豆杉(Pseudotaxus chienii)嫩叶总DNA,进行RAPD分析.分别研究了模板DNA、引物、dNTPs、Mg2 和TaqDNA聚合酶用量对RAPDPCR扩增反应结果的影响.筛选并建立了适合于白豆杉RAPD扩增的反应体系:总体积25μL,其中10×PCR缓冲液(500mmol/L KCl,100mmol/L Tris-HCl,1.0%Triton X-100,20mmol/L MgCl2)2.0μL,引物(1.5μmol/L)0.5μL,dNTPs(10mmol/L)0.4μL,模板1μL(35ng),Taq酶0.8μL(0.5U),水20.3μL. 相似文献
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采用改良的SDS法提取黄瓜种子基因组DNA,并以其为模板对影响RAPD扩增反应的主要因子采用单因素递进分析方法进行优化,建立了黄瓜种子基因组DNA最佳RAPD反应体系,即20 μl的反应体积中含有60ng模板,1.2U Taq DNA聚合酶,3.0 mmol/L MgCl2,0.20 mmol/L dNTP,1.40 μmol/L引物. 相似文献
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以渐危植物海菜花基因组DNA为研究对象,筛选引物UBC-818【序列为（CA）8G】研究并确定了该引物适宜的退火温度,对影响ISSR扩增效果的主要参数进行筛选和优化,确定了海菜花的ISSR分析的最佳反应体系：15μL反应体系中含25ng模板DNA,0．2mmol·L^-1引物,0．2μmol·L^-1dNTPs,2．0mmol·L^-1Mg^2＋,0．5UTaq酶,1．5μL10×PCRBufferMg2＋（-）[100mmol·L^-1Tris—HCl（pH8．3）,500mmol·L^-1KCl]． 相似文献
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韩颖 《内江师范学院学报》2008,23(2):51-54
采用改进的CTAB法,成功地提取了北野豌豆及其近缘种的基因组DNA,电泳结果显示DNA质量和产量均较高,并以此DNA为模板,对ISSR的反应条件进行了优化,最终确定ISSR的反应体系为：总体积10μl,包括10ng的DNA,1倍的反应缓冲液,1．5mmol·L^-1MgCl2,2×10^-4mmol·L^-1（引物6和引物8）或2×10^-3mmol·L^-1（引物5,10和12）引物,0．2mmol·L^-1dNTP混合物和1．0U的Taq DNA聚合酶．ISSR扩增程序为：先在94℃下变性3min,然后在92℃下变性30s,50℃（引物5,6,10,12）或55．2℃（引物8）下复性30s,72℃下延伸1min,反应30个循环,最后72℃延伸5min．并基于此反应条件,最终筛选出5条ISSR引物用于进一步的研究． 相似文献
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采用改进的CTAB法提取中国特有濒危裸子植物白豆杉(Pseudotaxus chienii)嫩叶总DNA,进行RAPD分析.分别研究了模板DNA、引物、dNTPs、Mg2 和TaqDNA聚合酶用量对RAPD PCR扩增反应结果的影响.筛选并建立了适合于白豆杉RAPD扩增的反应体系:总体积25μL,其中10×PCR缓冲液(500 mmol/L KCl,100 mmol/L Tris-HCl,1.0%Triton X-100,20 mmol/L MgCl2)2.0μL,引物(1.5μmol/L)0.5μL,dNTPs(10 mmol/L)0.4μL,模板1μL(35 ng),Taq酶0.8μL(0.5 U),水20.3 μL. 相似文献
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呼吸道感染铜绿假单胞菌RAPD分型与抗生素耐药谱分型比较研究 总被引：1，自引：0，他引：1
目的：调查张家口地区呼吸道感染铜绿假单胞菌的分子流行病学情况，为临床防治提供依据。方法：用随机扩增DNA多态性分析技术对31株铜绿假单胞菌进行分型，并与抗生素耐药谱分型比较。结果：31株铜绿假单胞菌RAPD分型共有9种不同的基因型，其中基因A型17株，占54．8％。抗生素耐药谱分型有6型。结论：基因A型为优势菌株，且为多重耐药，是这一年来张家口地区呼吸遭感染的相关菌株，RAPD分型在医院呼吸道感染铜绿假单胞菌流行病学的研究中有较大应用价值。 相似文献